Protein–RNA interactions for Protein: Q80UK0

Sestd1, SEC14 domain and spectrin repeat-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 696 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sestd1Q80UK0 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Sestd1Q80UK0 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Sestd1Q80UK0 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Sestd1Q80UK0 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Sestd1Q80UK0 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Sestd1Q80UK0 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Sestd1Q80UK0 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Sestd1Q80UK0 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Sestd1Q80UK0 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Sestd1Q80UK0 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Sestd1Q80UK0 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Sestd1Q80UK0 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Sestd1Q80UK0 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Sestd1Q80UK0 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Sestd1Q80UK0 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Sestd1Q80UK0 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Sestd1Q80UK0 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Sestd1Q80UK0 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Sestd1Q80UK0 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Sestd1Q80UK0 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Sestd1Q80UK0 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
Sestd1Q80UK0 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
Sestd1Q80UK0 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Sestd1Q80UK0 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Sestd1Q80UK0 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Sestd1Q80UK0 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Sestd1Q80UK0 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Sestd1Q80UK0 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Sestd1Q80UK0 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Sestd1Q80UK0 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
Sestd1Q80UK0 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Sestd1Q80UK0 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Sestd1Q80UK0 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Sestd1Q80UK0 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Sestd1Q80UK0 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Sestd1Q80UK0 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Sestd1Q80UK0 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
Sestd1Q80UK0 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Sestd1Q80UK0 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Sestd1Q80UK0 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
Sestd1Q80UK0 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
Sestd1Q80UK0 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Sestd1Q80UK0 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Sestd1Q80UK0 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Sestd1Q80UK0 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Sestd1Q80UK0 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Sestd1Q80UK0 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Sestd1Q80UK0 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Sestd1Q80UK0 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Sestd1Q80UK0 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Sestd1Q80UK0 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Sestd1Q80UK0 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Sestd1Q80UK0 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Sestd1Q80UK0 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Sestd1Q80UK0 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Sestd1Q80UK0 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Sestd1Q80UK0 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Sestd1Q80UK0 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Sestd1Q80UK0 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Sestd1Q80UK0 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Sestd1Q80UK0 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Sestd1Q80UK0 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Sestd1Q80UK0 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Sestd1Q80UK0 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Sestd1Q80UK0 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Sestd1Q80UK0 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Sestd1Q80UK0 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Sestd1Q80UK0 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Sestd1Q80UK0 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Sestd1Q80UK0 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Sestd1Q80UK0 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Sestd1Q80UK0 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Sestd1Q80UK0 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Sestd1Q80UK0 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Sestd1Q80UK0 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Sestd1Q80UK0 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Sestd1Q80UK0 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Sestd1Q80UK0 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Sestd1Q80UK0 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Sestd1Q80UK0 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Sestd1Q80UK0 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Sestd1Q80UK0 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Sestd1Q80UK0 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Sestd1Q80UK0 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Sestd1Q80UK0 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Sestd1Q80UK0 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Sestd1Q80UK0 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Sestd1Q80UK0 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Sestd1Q80UK0 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Sestd1Q80UK0 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Sestd1Q80UK0 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Sestd1Q80UK0 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Sestd1Q80UK0 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Sestd1Q80UK0 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Sestd1Q80UK0 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Sestd1Q80UK0 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Sestd1Q80UK0 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Sestd1Q80UK0 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Sestd1Q80UK0 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Sestd1Q80UK0 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.7 ms