Protein–RNA interactions for Protein: Q80TT8

Cul9, Cullin-9, mousemouse

Predictions only

Length 1,865 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cul9Q80TT8 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
Cul9Q80TT8 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC26.72■■□□□ 1.87
Cul9Q80TT8 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Cul9Q80TT8 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Cul9Q80TT8 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Cul9Q80TT8 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Cul9Q80TT8 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
Cul9Q80TT8 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Cul9Q80TT8 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Cul9Q80TT8 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Cul9Q80TT8 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Cul9Q80TT8 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Cul9Q80TT8 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
Cul9Q80TT8 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Cul9Q80TT8 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Cul9Q80TT8 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Cul9Q80TT8 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Cul9Q80TT8 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Cul9Q80TT8 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
Cul9Q80TT8 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC26.7■■□□□ 1.87
Cul9Q80TT8 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Cul9Q80TT8 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Cul9Q80TT8 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Cul9Q80TT8 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Cul9Q80TT8 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
Cul9Q80TT8 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Cul9Q80TT8 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Cul9Q80TT8 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Cul9Q80TT8 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
Cul9Q80TT8 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Cul9Q80TT8 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Cul9Q80TT8 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Cul9Q80TT8 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC26.69■■□□□ 1.86
Cul9Q80TT8 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC26.69■■□□□ 1.86
Cul9Q80TT8 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Cul9Q80TT8 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Cul9Q80TT8 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
Cul9Q80TT8 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
Cul9Q80TT8 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Cul9Q80TT8 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Cul9Q80TT8 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Cul9Q80TT8 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
Cul9Q80TT8 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Cul9Q80TT8 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Cul9Q80TT8 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Cul9Q80TT8 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
Cul9Q80TT8 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC26.67■■□□□ 1.86
Cul9Q80TT8 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Cul9Q80TT8 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Cul9Q80TT8 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
Cul9Q80TT8 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Cul9Q80TT8 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Cul9Q80TT8 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Cul9Q80TT8 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC26.66■■□□□ 1.86
Cul9Q80TT8 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Cul9Q80TT8 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
Cul9Q80TT8 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC26.66■■□□□ 1.86
Cul9Q80TT8 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Cul9Q80TT8 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Cul9Q80TT8 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
Cul9Q80TT8 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Cul9Q80TT8 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Cul9Q80TT8 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
Cul9Q80TT8 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Cul9Q80TT8 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC26.66■■□□□ 1.86
Cul9Q80TT8 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
Cul9Q80TT8 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
Cul9Q80TT8 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Cul9Q80TT8 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Cul9Q80TT8 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Cul9Q80TT8 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Cul9Q80TT8 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Cul9Q80TT8 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Cul9Q80TT8 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Cul9Q80TT8 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Cul9Q80TT8 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Cul9Q80TT8 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Cul9Q80TT8 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Cul9Q80TT8 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
Cul9Q80TT8 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC26.64■■□□□ 1.85
Cul9Q80TT8 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
Cul9Q80TT8 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.85
Cul9Q80TT8 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
Cul9Q80TT8 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC26.64■■□□□ 1.85
Cul9Q80TT8 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
Cul9Q80TT8 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
Cul9Q80TT8 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Cul9Q80TT8 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC26.63■■□□□ 1.85
Cul9Q80TT8 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
Cul9Q80TT8 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Cul9Q80TT8 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Cul9Q80TT8 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Cul9Q80TT8 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Cul9Q80TT8 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.62■■□□□ 1.85
Cul9Q80TT8 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
Cul9Q80TT8 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC26.62■■□□□ 1.85
Cul9Q80TT8 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
Cul9Q80TT8 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Cul9Q80TT8 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Cul9Q80TT8 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.9 ms