Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSY8

Sgo2, Shugoshin 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,164 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sgo2Q7TSY8 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Sgo2Q7TSY8 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Sgo2Q7TSY8 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Sgo2Q7TSY8 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Sgo2Q7TSY8 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Sgo2Q7TSY8 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Sgo2Q7TSY8 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Sgo2Q7TSY8 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Sgo2Q7TSY8 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Sgo2Q7TSY8 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Sgo2Q7TSY8 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Sgo2Q7TSY8 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Sgo2Q7TSY8 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Sgo2Q7TSY8 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Sgo2Q7TSY8 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Sgo2Q7TSY8 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Sgo2Q7TSY8 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Sgo2Q7TSY8 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Sgo2Q7TSY8 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Sgo2Q7TSY8 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Sgo2Q7TSY8 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Sgo2Q7TSY8 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Sgo2Q7TSY8 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Sgo2Q7TSY8 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Sgo2Q7TSY8 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Sgo2Q7TSY8 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Sgo2Q7TSY8 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Sgo2Q7TSY8 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Sgo2Q7TSY8 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Sgo2Q7TSY8 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Sgo2Q7TSY8 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Sgo2Q7TSY8 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Sgo2Q7TSY8 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Sgo2Q7TSY8 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Sgo2Q7TSY8 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Sgo2Q7TSY8 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Sgo2Q7TSY8 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Sgo2Q7TSY8 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Sgo2Q7TSY8 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Sgo2Q7TSY8 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Sgo2Q7TSY8 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Sgo2Q7TSY8 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Sgo2Q7TSY8 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Sgo2Q7TSY8 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Sgo2Q7TSY8 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Sgo2Q7TSY8 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Sgo2Q7TSY8 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Sgo2Q7TSY8 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Sgo2Q7TSY8 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Sgo2Q7TSY8 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Sgo2Q7TSY8 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Sgo2Q7TSY8 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Sgo2Q7TSY8 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Sgo2Q7TSY8 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Sgo2Q7TSY8 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Sgo2Q7TSY8 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Sgo2Q7TSY8 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Sgo2Q7TSY8 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Sgo2Q7TSY8 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Sgo2Q7TSY8 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Sgo2Q7TSY8 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Sgo2Q7TSY8 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Sgo2Q7TSY8 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Sgo2Q7TSY8 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Sgo2Q7TSY8 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Sgo2Q7TSY8 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Sgo2Q7TSY8 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Sgo2Q7TSY8 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Sgo2Q7TSY8 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Sgo2Q7TSY8 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Sgo2Q7TSY8 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Sgo2Q7TSY8 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Sgo2Q7TSY8 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Sgo2Q7TSY8 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Sgo2Q7TSY8 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Sgo2Q7TSY8 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Sgo2Q7TSY8 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Sgo2Q7TSY8 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Sgo2Q7TSY8 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Sgo2Q7TSY8 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Sgo2Q7TSY8 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Sgo2Q7TSY8 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Sgo2Q7TSY8 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Sgo2Q7TSY8 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Sgo2Q7TSY8 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Sgo2Q7TSY8 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Sgo2Q7TSY8 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Sgo2Q7TSY8 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Sgo2Q7TSY8 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Sgo2Q7TSY8 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Sgo2Q7TSY8 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Sgo2Q7TSY8 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Sgo2Q7TSY8 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Sgo2Q7TSY8 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Sgo2Q7TSY8 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Sgo2Q7TSY8 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Sgo2Q7TSY8 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Sgo2Q7TSY8 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Sgo2Q7TSY8 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Sgo2Q7TSY8 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12 ms