Protein–RNA interactions for Protein: Q7TNH6

Nphp3, Nephrocystin-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nphp3Q7TNH6 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Nphp3Q7TNH6 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Nphp3Q7TNH6 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Nphp3Q7TNH6 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Nphp3Q7TNH6 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Nphp3Q7TNH6 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Nphp3Q7TNH6 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Nphp3Q7TNH6 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
Nphp3Q7TNH6 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Nphp3Q7TNH6 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Nphp3Q7TNH6 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Nphp3Q7TNH6 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Nphp3Q7TNH6 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Nphp3Q7TNH6 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Nphp3Q7TNH6 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Nphp3Q7TNH6 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Nphp3Q7TNH6 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Nphp3Q7TNH6 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Nphp3Q7TNH6 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Nphp3Q7TNH6 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Nphp3Q7TNH6 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Nphp3Q7TNH6 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Nphp3Q7TNH6 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Nphp3Q7TNH6 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Nphp3Q7TNH6 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Nphp3Q7TNH6 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Nphp3Q7TNH6 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Nphp3Q7TNH6 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Nphp3Q7TNH6 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Nphp3Q7TNH6 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Nphp3Q7TNH6 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Nphp3Q7TNH6 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Nphp3Q7TNH6 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Nphp3Q7TNH6 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Nphp3Q7TNH6 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Nphp3Q7TNH6 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Nphp3Q7TNH6 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Nphp3Q7TNH6 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Nphp3Q7TNH6 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Nphp3Q7TNH6 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Nphp3Q7TNH6 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Nphp3Q7TNH6 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Nphp3Q7TNH6 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Nphp3Q7TNH6 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Nphp3Q7TNH6 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Nphp3Q7TNH6 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Nphp3Q7TNH6 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Nphp3Q7TNH6 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Nphp3Q7TNH6 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Nphp3Q7TNH6 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Nphp3Q7TNH6 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Nphp3Q7TNH6 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Nphp3Q7TNH6 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Nphp3Q7TNH6 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Nphp3Q7TNH6 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Nphp3Q7TNH6 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Nphp3Q7TNH6 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Nphp3Q7TNH6 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Nphp3Q7TNH6 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Nphp3Q7TNH6 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Nphp3Q7TNH6 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Nphp3Q7TNH6 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Nphp3Q7TNH6 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Nphp3Q7TNH6 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Nphp3Q7TNH6 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Nphp3Q7TNH6 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Nphp3Q7TNH6 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Nphp3Q7TNH6 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Nphp3Q7TNH6 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Nphp3Q7TNH6 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Nphp3Q7TNH6 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Nphp3Q7TNH6 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Nphp3Q7TNH6 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Nphp3Q7TNH6 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Nphp3Q7TNH6 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Nphp3Q7TNH6 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Nphp3Q7TNH6 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Nphp3Q7TNH6 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Nphp3Q7TNH6 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Nphp3Q7TNH6 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Nphp3Q7TNH6 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Nphp3Q7TNH6 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Nphp3Q7TNH6 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Nphp3Q7TNH6 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Nphp3Q7TNH6 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Nphp3Q7TNH6 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Nphp3Q7TNH6 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Nphp3Q7TNH6 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Nphp3Q7TNH6 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Nphp3Q7TNH6 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Nphp3Q7TNH6 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Nphp3Q7TNH6 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Nphp3Q7TNH6 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Nphp3Q7TNH6 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Nphp3Q7TNH6 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Nphp3Q7TNH6 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Nphp3Q7TNH6 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Nphp3Q7TNH6 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Nphp3Q7TNH6 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Nphp3Q7TNH6 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.7 ms