Protein–RNA interactions for Protein: Q7TMX5

Shq1, Protein SHQ1 homolog, mousemouse

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Length 569 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shq1Q7TMX5 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Shq1Q7TMX5 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Shq1Q7TMX5 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Shq1Q7TMX5 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Shq1Q7TMX5 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Shq1Q7TMX5 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Shq1Q7TMX5 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Shq1Q7TMX5 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Shq1Q7TMX5 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Shq1Q7TMX5 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Shq1Q7TMX5 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
Shq1Q7TMX5 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Shq1Q7TMX5 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Shq1Q7TMX5 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.68
Shq1Q7TMX5 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.68
Shq1Q7TMX5 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Shq1Q7TMX5 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Shq1Q7TMX5 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Shq1Q7TMX5 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Shq1Q7TMX5 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Shq1Q7TMX5 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
Shq1Q7TMX5 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Shq1Q7TMX5 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
Shq1Q7TMX5 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Shq1Q7TMX5 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Shq1Q7TMX5 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Shq1Q7TMX5 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Shq1Q7TMX5 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Shq1Q7TMX5 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Shq1Q7TMX5 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Shq1Q7TMX5 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Shq1Q7TMX5 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Shq1Q7TMX5 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Shq1Q7TMX5 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Shq1Q7TMX5 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Shq1Q7TMX5 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
Shq1Q7TMX5 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Shq1Q7TMX5 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Shq1Q7TMX5 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Shq1Q7TMX5 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Shq1Q7TMX5 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Shq1Q7TMX5 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Shq1Q7TMX5 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Shq1Q7TMX5 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Shq1Q7TMX5 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
Shq1Q7TMX5 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
Shq1Q7TMX5 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Shq1Q7TMX5 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Shq1Q7TMX5 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Shq1Q7TMX5 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Shq1Q7TMX5 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Shq1Q7TMX5 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Shq1Q7TMX5 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Shq1Q7TMX5 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Shq1Q7TMX5 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Shq1Q7TMX5 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Shq1Q7TMX5 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
Shq1Q7TMX5 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Shq1Q7TMX5 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Shq1Q7TMX5 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Shq1Q7TMX5 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Shq1Q7TMX5 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Shq1Q7TMX5 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Shq1Q7TMX5 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Shq1Q7TMX5 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Shq1Q7TMX5 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Shq1Q7TMX5 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Shq1Q7TMX5 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Shq1Q7TMX5 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Shq1Q7TMX5 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Shq1Q7TMX5 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Shq1Q7TMX5 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Shq1Q7TMX5 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Shq1Q7TMX5 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Shq1Q7TMX5 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Shq1Q7TMX5 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Shq1Q7TMX5 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Shq1Q7TMX5 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Shq1Q7TMX5 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Shq1Q7TMX5 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Shq1Q7TMX5 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Shq1Q7TMX5 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Shq1Q7TMX5 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Shq1Q7TMX5 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Shq1Q7TMX5 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Shq1Q7TMX5 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Shq1Q7TMX5 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Shq1Q7TMX5 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Shq1Q7TMX5 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Shq1Q7TMX5 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Shq1Q7TMX5 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Shq1Q7TMX5 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Shq1Q7TMX5 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Shq1Q7TMX5 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Shq1Q7TMX5 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Shq1Q7TMX5 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Shq1Q7TMX5 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Shq1Q7TMX5 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Shq1Q7TMX5 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Shq1Q7TMX5 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
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