Protein–RNA interactions for Protein: Q78YZ6

Scoc, Short coiled-coil protein, mousemouse

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Length 125 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ScocQ78YZ6 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ScocQ78YZ6 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ScocQ78YZ6 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ScocQ78YZ6 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ScocQ78YZ6 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ScocQ78YZ6 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ScocQ78YZ6 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ScocQ78YZ6 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ScocQ78YZ6 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ScocQ78YZ6 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ScocQ78YZ6 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ScocQ78YZ6 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ScocQ78YZ6 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ScocQ78YZ6 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ScocQ78YZ6 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ScocQ78YZ6 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ScocQ78YZ6 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ScocQ78YZ6 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ScocQ78YZ6 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
ScocQ78YZ6 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ScocQ78YZ6 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ScocQ78YZ6 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ScocQ78YZ6 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ScocQ78YZ6 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ScocQ78YZ6 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ScocQ78YZ6 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ScocQ78YZ6 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ScocQ78YZ6 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
ScocQ78YZ6 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ScocQ78YZ6 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ScocQ78YZ6 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ScocQ78YZ6 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ScocQ78YZ6 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ScocQ78YZ6 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
ScocQ78YZ6 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ScocQ78YZ6 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ScocQ78YZ6 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ScocQ78YZ6 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ScocQ78YZ6 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ScocQ78YZ6 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ScocQ78YZ6 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ScocQ78YZ6 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ScocQ78YZ6 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ScocQ78YZ6 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ScocQ78YZ6 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ScocQ78YZ6 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ScocQ78YZ6 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ScocQ78YZ6 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ScocQ78YZ6 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ScocQ78YZ6 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ScocQ78YZ6 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ScocQ78YZ6 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
ScocQ78YZ6 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ScocQ78YZ6 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ScocQ78YZ6 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ScocQ78YZ6 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ScocQ78YZ6 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ScocQ78YZ6 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ScocQ78YZ6 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ScocQ78YZ6 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ScocQ78YZ6 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ScocQ78YZ6 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ScocQ78YZ6 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ScocQ78YZ6 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ScocQ78YZ6 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ScocQ78YZ6 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ScocQ78YZ6 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ScocQ78YZ6 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ScocQ78YZ6 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ScocQ78YZ6 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ScocQ78YZ6 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ScocQ78YZ6 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ScocQ78YZ6 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
ScocQ78YZ6 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ScocQ78YZ6 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ScocQ78YZ6 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ScocQ78YZ6 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ScocQ78YZ6 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ScocQ78YZ6 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ScocQ78YZ6 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ScocQ78YZ6 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ScocQ78YZ6 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ScocQ78YZ6 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ScocQ78YZ6 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ScocQ78YZ6 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ScocQ78YZ6 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ScocQ78YZ6 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ScocQ78YZ6 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ScocQ78YZ6 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ScocQ78YZ6 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ScocQ78YZ6 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ScocQ78YZ6 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ScocQ78YZ6 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ScocQ78YZ6 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
ScocQ78YZ6 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ScocQ78YZ6 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ScocQ78YZ6 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ScocQ78YZ6 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ScocQ78YZ6 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ScocQ78YZ6 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 168.8 ms