Protein–RNA interactions for Protein: Q78WZ7

Twistnb, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA43, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 330 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TwistnbQ78WZ7 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
TwistnbQ78WZ7 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
TwistnbQ78WZ7 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
TwistnbQ78WZ7 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
TwistnbQ78WZ7 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
TwistnbQ78WZ7 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
TwistnbQ78WZ7 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
TwistnbQ78WZ7 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
TwistnbQ78WZ7 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
TwistnbQ78WZ7 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
TwistnbQ78WZ7 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
TwistnbQ78WZ7 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
TwistnbQ78WZ7 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
TwistnbQ78WZ7 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
TwistnbQ78WZ7 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
TwistnbQ78WZ7 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
TwistnbQ78WZ7 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
TwistnbQ78WZ7 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TwistnbQ78WZ7 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
TwistnbQ78WZ7 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
TwistnbQ78WZ7 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TwistnbQ78WZ7 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
TwistnbQ78WZ7 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
TwistnbQ78WZ7 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TwistnbQ78WZ7 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TwistnbQ78WZ7 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TwistnbQ78WZ7 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
TwistnbQ78WZ7 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TwistnbQ78WZ7 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TwistnbQ78WZ7 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TwistnbQ78WZ7 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TwistnbQ78WZ7 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TwistnbQ78WZ7 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TwistnbQ78WZ7 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TwistnbQ78WZ7 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
TwistnbQ78WZ7 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TwistnbQ78WZ7 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TwistnbQ78WZ7 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
TwistnbQ78WZ7 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TwistnbQ78WZ7 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TwistnbQ78WZ7 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TwistnbQ78WZ7 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TwistnbQ78WZ7 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
TwistnbQ78WZ7 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
TwistnbQ78WZ7 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TwistnbQ78WZ7 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TwistnbQ78WZ7 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
TwistnbQ78WZ7 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TwistnbQ78WZ7 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TwistnbQ78WZ7 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TwistnbQ78WZ7 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TwistnbQ78WZ7 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TwistnbQ78WZ7 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
TwistnbQ78WZ7 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TwistnbQ78WZ7 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TwistnbQ78WZ7 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TwistnbQ78WZ7 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
TwistnbQ78WZ7 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TwistnbQ78WZ7 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TwistnbQ78WZ7 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TwistnbQ78WZ7 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
TwistnbQ78WZ7 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
TwistnbQ78WZ7 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
TwistnbQ78WZ7 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TwistnbQ78WZ7 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TwistnbQ78WZ7 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TwistnbQ78WZ7 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TwistnbQ78WZ7 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
TwistnbQ78WZ7 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
TwistnbQ78WZ7 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
TwistnbQ78WZ7 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
TwistnbQ78WZ7 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
TwistnbQ78WZ7 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC18.71■□□□□ 0.59
TwistnbQ78WZ7 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
TwistnbQ78WZ7 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
TwistnbQ78WZ7 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
TwistnbQ78WZ7 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
TwistnbQ78WZ7 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
TwistnbQ78WZ7 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
TwistnbQ78WZ7 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
TwistnbQ78WZ7 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TwistnbQ78WZ7 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TwistnbQ78WZ7 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TwistnbQ78WZ7 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TwistnbQ78WZ7 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
TwistnbQ78WZ7 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TwistnbQ78WZ7 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TwistnbQ78WZ7 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TwistnbQ78WZ7 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TwistnbQ78WZ7 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
TwistnbQ78WZ7 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
TwistnbQ78WZ7 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TwistnbQ78WZ7 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TwistnbQ78WZ7 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TwistnbQ78WZ7 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
TwistnbQ78WZ7 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
TwistnbQ78WZ7 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
TwistnbQ78WZ7 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
TwistnbQ78WZ7 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
TwistnbQ78WZ7 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.5 ms