Protein–RNA interactions for Protein: Q78JN3

Eci3, Enoyl-CoA delta isomerase 3, peroxisomal, mousemouse

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Eci3Q78JN3 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Eci3Q78JN3 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Eci3Q78JN3 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Eci3Q78JN3 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Eci3Q78JN3 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Eci3Q78JN3 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Eci3Q78JN3 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Eci3Q78JN3 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Eci3Q78JN3 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Eci3Q78JN3 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Eci3Q78JN3 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Eci3Q78JN3 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Eci3Q78JN3 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Eci3Q78JN3 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Eci3Q78JN3 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Eci3Q78JN3 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Eci3Q78JN3 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Eci3Q78JN3 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Eci3Q78JN3 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Eci3Q78JN3 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Eci3Q78JN3 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Eci3Q78JN3 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Eci3Q78JN3 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Eci3Q78JN3 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Eci3Q78JN3 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Eci3Q78JN3 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Eci3Q78JN3 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Eci3Q78JN3 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Eci3Q78JN3 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Eci3Q78JN3 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Eci3Q78JN3 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Eci3Q78JN3 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Eci3Q78JN3 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Eci3Q78JN3 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Eci3Q78JN3 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Eci3Q78JN3 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Eci3Q78JN3 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Eci3Q78JN3 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Eci3Q78JN3 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Eci3Q78JN3 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Eci3Q78JN3 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Eci3Q78JN3 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Eci3Q78JN3 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Eci3Q78JN3 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Eci3Q78JN3 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Eci3Q78JN3 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Eci3Q78JN3 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Eci3Q78JN3 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Eci3Q78JN3 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Eci3Q78JN3 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Eci3Q78JN3 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Eci3Q78JN3 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Eci3Q78JN3 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Eci3Q78JN3 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Eci3Q78JN3 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Eci3Q78JN3 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Eci3Q78JN3 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Eci3Q78JN3 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Eci3Q78JN3 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Eci3Q78JN3 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Eci3Q78JN3 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Eci3Q78JN3 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Eci3Q78JN3 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Eci3Q78JN3 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Eci3Q78JN3 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Eci3Q78JN3 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Eci3Q78JN3 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Eci3Q78JN3 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Eci3Q78JN3 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Eci3Q78JN3 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Eci3Q78JN3 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Eci3Q78JN3 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Eci3Q78JN3 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Eci3Q78JN3 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Eci3Q78JN3 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Eci3Q78JN3 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Eci3Q78JN3 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Eci3Q78JN3 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Eci3Q78JN3 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Eci3Q78JN3 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Eci3Q78JN3 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Eci3Q78JN3 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Eci3Q78JN3 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Eci3Q78JN3 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Eci3Q78JN3 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Eci3Q78JN3 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Eci3Q78JN3 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Eci3Q78JN3 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Eci3Q78JN3 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Eci3Q78JN3 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Eci3Q78JN3 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Eci3Q78JN3 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Eci3Q78JN3 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Eci3Q78JN3 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Eci3Q78JN3 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Eci3Q78JN3 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Eci3Q78JN3 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Eci3Q78JN3 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Eci3Q78JN3 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Eci3Q78JN3 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.2 ms