Protein–RNA interactions for Protein: Q768S4

Rph3al, Rab effector Noc2, mousemouse

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Length 302 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rph3alQ768S4 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Rph3alQ768S4 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Rph3alQ768S4 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Rph3alQ768S4 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Rph3alQ768S4 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Rph3alQ768S4 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Rph3alQ768S4 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Rph3alQ768S4 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Rph3alQ768S4 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Rph3alQ768S4 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Rph3alQ768S4 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Rph3alQ768S4 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Rph3alQ768S4 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Rph3alQ768S4 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Rph3alQ768S4 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Rph3alQ768S4 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Rph3alQ768S4 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Rph3alQ768S4 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Rph3alQ768S4 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Rph3alQ768S4 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Rph3alQ768S4 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Rph3alQ768S4 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Rph3alQ768S4 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Rph3alQ768S4 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rph3alQ768S4 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rph3alQ768S4 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rph3alQ768S4 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Rph3alQ768S4 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Rph3alQ768S4 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rph3alQ768S4 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rph3alQ768S4 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rph3alQ768S4 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rph3alQ768S4 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rph3alQ768S4 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rph3alQ768S4 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rph3alQ768S4 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rph3alQ768S4 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Rph3alQ768S4 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rph3alQ768S4 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Rph3alQ768S4 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rph3alQ768S4 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Rph3alQ768S4 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rph3alQ768S4 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rph3alQ768S4 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rph3alQ768S4 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rph3alQ768S4 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rph3alQ768S4 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rph3alQ768S4 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rph3alQ768S4 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rph3alQ768S4 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rph3alQ768S4 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rph3alQ768S4 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rph3alQ768S4 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rph3alQ768S4 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rph3alQ768S4 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rph3alQ768S4 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rph3alQ768S4 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rph3alQ768S4 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rph3alQ768S4 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Rph3alQ768S4 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rph3alQ768S4 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Rph3alQ768S4 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rph3alQ768S4 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rph3alQ768S4 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rph3alQ768S4 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rph3alQ768S4 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Rph3alQ768S4 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rph3alQ768S4 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rph3alQ768S4 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rph3alQ768S4 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rph3alQ768S4 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rph3alQ768S4 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rph3alQ768S4 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rph3alQ768S4 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rph3alQ768S4 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Rph3alQ768S4 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rph3alQ768S4 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rph3alQ768S4 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rph3alQ768S4 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rph3alQ768S4 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rph3alQ768S4 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rph3alQ768S4 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rph3alQ768S4 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rph3alQ768S4 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rph3alQ768S4 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rph3alQ768S4 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rph3alQ768S4 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rph3alQ768S4 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rph3alQ768S4 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rph3alQ768S4 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rph3alQ768S4 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rph3alQ768S4 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rph3alQ768S4 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rph3alQ768S4 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rph3alQ768S4 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rph3alQ768S4 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rph3alQ768S4 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rph3alQ768S4 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Rph3alQ768S4 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rph3alQ768S4 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
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