Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZQL4

Wdr43, WD repeat-containing protein 43, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 677 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Wdr43Q6ZQL4 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Wdr43Q6ZQL4 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Wdr43Q6ZQL4 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Wdr43Q6ZQL4 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Wdr43Q6ZQL4 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Wdr43Q6ZQL4 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
Wdr43Q6ZQL4 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Wdr43Q6ZQL4 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Wdr43Q6ZQL4 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Wdr43Q6ZQL4 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Wdr43Q6ZQL4 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Wdr43Q6ZQL4 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Wdr43Q6ZQL4 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Wdr43Q6ZQL4 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Wdr43Q6ZQL4 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Wdr43Q6ZQL4 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Wdr43Q6ZQL4 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Wdr43Q6ZQL4 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Wdr43Q6ZQL4 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Wdr43Q6ZQL4 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Wdr43Q6ZQL4 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Wdr43Q6ZQL4 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Wdr43Q6ZQL4 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Wdr43Q6ZQL4 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Wdr43Q6ZQL4 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Wdr43Q6ZQL4 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Wdr43Q6ZQL4 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Wdr43Q6ZQL4 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Wdr43Q6ZQL4 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Wdr43Q6ZQL4 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Wdr43Q6ZQL4 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Wdr43Q6ZQL4 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Wdr43Q6ZQL4 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Wdr43Q6ZQL4 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Wdr43Q6ZQL4 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Wdr43Q6ZQL4 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Wdr43Q6ZQL4 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Wdr43Q6ZQL4 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Wdr43Q6ZQL4 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Wdr43Q6ZQL4 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Wdr43Q6ZQL4 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Wdr43Q6ZQL4 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Wdr43Q6ZQL4 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Wdr43Q6ZQL4 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Wdr43Q6ZQL4 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Wdr43Q6ZQL4 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Wdr43Q6ZQL4 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Wdr43Q6ZQL4 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Wdr43Q6ZQL4 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Wdr43Q6ZQL4 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Wdr43Q6ZQL4 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Wdr43Q6ZQL4 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Wdr43Q6ZQL4 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Wdr43Q6ZQL4 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Wdr43Q6ZQL4 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Wdr43Q6ZQL4 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Wdr43Q6ZQL4 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Wdr43Q6ZQL4 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Wdr43Q6ZQL4 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Wdr43Q6ZQL4 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Wdr43Q6ZQL4 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Wdr43Q6ZQL4 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Wdr43Q6ZQL4 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Wdr43Q6ZQL4 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Wdr43Q6ZQL4 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Wdr43Q6ZQL4 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Wdr43Q6ZQL4 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Wdr43Q6ZQL4 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Wdr43Q6ZQL4 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Wdr43Q6ZQL4 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Wdr43Q6ZQL4 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Wdr43Q6ZQL4 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Wdr43Q6ZQL4 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Wdr43Q6ZQL4 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Wdr43Q6ZQL4 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Wdr43Q6ZQL4 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Wdr43Q6ZQL4 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Wdr43Q6ZQL4 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Wdr43Q6ZQL4 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Wdr43Q6ZQL4 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Wdr43Q6ZQL4 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Wdr43Q6ZQL4 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Wdr43Q6ZQL4 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Wdr43Q6ZQL4 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Wdr43Q6ZQL4 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Wdr43Q6ZQL4 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Wdr43Q6ZQL4 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Wdr43Q6ZQL4 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Wdr43Q6ZQL4 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Wdr43Q6ZQL4 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
Wdr43Q6ZQL4 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Wdr43Q6ZQL4 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Wdr43Q6ZQL4 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Wdr43Q6ZQL4 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Wdr43Q6ZQL4 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Wdr43Q6ZQL4 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Wdr43Q6ZQL4 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Wdr43Q6ZQL4 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Wdr43Q6ZQL4 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Wdr43Q6ZQL4 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.3 ms