Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZQK0

Ncapd3, Condensin-2 complex subunit D3, mousemouse

Predictions only

Length 1,506 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ncapd3Q6ZQK0 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Ncapd3Q6ZQK0 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
Ncapd3Q6ZQK0 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC28.02■■■□□ 2.08
Ncapd3Q6ZQK0 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Ncapd3Q6ZQK0 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Ncapd3Q6ZQK0 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
Ncapd3Q6ZQK0 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Ncapd3Q6ZQK0 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Ncapd3Q6ZQK0 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Ncapd3Q6ZQK0 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Ncapd3Q6ZQK0 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC28.01■■■□□ 2.07
Ncapd3Q6ZQK0 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Ncapd3Q6ZQK0 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Ncapd3Q6ZQK0 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Ncapd3Q6ZQK0 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Ncapd3Q6ZQK0 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
Ncapd3Q6ZQK0 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
Ncapd3Q6ZQK0 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
Ncapd3Q6ZQK0 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
Ncapd3Q6ZQK0 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC28.01■■■□□ 2.07
Ncapd3Q6ZQK0 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Ncapd3Q6ZQK0 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
Ncapd3Q6ZQK0 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Ncapd3Q6ZQK0 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Ncapd3Q6ZQK0 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Ncapd3Q6ZQK0 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Ncapd3Q6ZQK0 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Ncapd3Q6ZQK0 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Ncapd3Q6ZQK0 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC28■■■□□ 2.07
Ncapd3Q6ZQK0 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Ncapd3Q6ZQK0 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Ncapd3Q6ZQK0 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Ncapd3Q6ZQK0 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Ncapd3Q6ZQK0 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Ncapd3Q6ZQK0 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Ncapd3Q6ZQK0 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Ncapd3Q6ZQK0 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Ncapd3Q6ZQK0 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
Ncapd3Q6ZQK0 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Ncapd3Q6ZQK0 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
Ncapd3Q6ZQK0 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC27.99■■■□□ 2.07
Ncapd3Q6ZQK0 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Ncapd3Q6ZQK0 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Ncapd3Q6ZQK0 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Ncapd3Q6ZQK0 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Ncapd3Q6ZQK0 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Ncapd3Q6ZQK0 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Ncapd3Q6ZQK0 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Ncapd3Q6ZQK0 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
Ncapd3Q6ZQK0 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
Ncapd3Q6ZQK0 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
Ncapd3Q6ZQK0 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Ncapd3Q6ZQK0 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Ncapd3Q6ZQK0 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Ncapd3Q6ZQK0 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Ncapd3Q6ZQK0 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Ncapd3Q6ZQK0 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Ncapd3Q6ZQK0 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Ncapd3Q6ZQK0 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
Ncapd3Q6ZQK0 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Ncapd3Q6ZQK0 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Ncapd3Q6ZQK0 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Ncapd3Q6ZQK0 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Ncapd3Q6ZQK0 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
Ncapd3Q6ZQK0 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Ncapd3Q6ZQK0 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Ncapd3Q6ZQK0 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Ncapd3Q6ZQK0 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Ncapd3Q6ZQK0 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
Ncapd3Q6ZQK0 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
Ncapd3Q6ZQK0 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC27.95■■■□□ 2.06
Ncapd3Q6ZQK0 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC27.95■■■□□ 2.06
Ncapd3Q6ZQK0 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
Ncapd3Q6ZQK0 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Ncapd3Q6ZQK0 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Ncapd3Q6ZQK0 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC27.95■■■□□ 2.06
Ncapd3Q6ZQK0 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC27.95■■■□□ 2.06
Ncapd3Q6ZQK0 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Ncapd3Q6ZQK0 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Ncapd3Q6ZQK0 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Ncapd3Q6ZQK0 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Ncapd3Q6ZQK0 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
Ncapd3Q6ZQK0 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Ncapd3Q6ZQK0 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
Ncapd3Q6ZQK0 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Ncapd3Q6ZQK0 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Ncapd3Q6ZQK0 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Ncapd3Q6ZQK0 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Ncapd3Q6ZQK0 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
Ncapd3Q6ZQK0 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Ncapd3Q6ZQK0 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Ncapd3Q6ZQK0 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Ncapd3Q6ZQK0 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC27.92■■■□□ 2.06
Ncapd3Q6ZQK0 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
Ncapd3Q6ZQK0 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Ncapd3Q6ZQK0 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Ncapd3Q6ZQK0 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Ncapd3Q6ZQK0 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC27.92■■■□□ 2.06
Ncapd3Q6ZQK0 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Ncapd3Q6ZQK0 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.3 ms