Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZQ11

Chsy1, Chondroitin sulfate synthase 1, mousemouse

Predictions only

Length 800 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chsy1Q6ZQ11 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Chsy1Q6ZQ11 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Chsy1Q6ZQ11 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Chsy1Q6ZQ11 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Chsy1Q6ZQ11 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Chsy1Q6ZQ11 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Chsy1Q6ZQ11 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Chsy1Q6ZQ11 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Chsy1Q6ZQ11 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Chsy1Q6ZQ11 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Chsy1Q6ZQ11 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Chsy1Q6ZQ11 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Chsy1Q6ZQ11 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Chsy1Q6ZQ11 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Chsy1Q6ZQ11 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Chsy1Q6ZQ11 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Chsy1Q6ZQ11 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Chsy1Q6ZQ11 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Chsy1Q6ZQ11 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Chsy1Q6ZQ11 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Chsy1Q6ZQ11 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Chsy1Q6ZQ11 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Chsy1Q6ZQ11 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Chsy1Q6ZQ11 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Chsy1Q6ZQ11 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Chsy1Q6ZQ11 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Chsy1Q6ZQ11 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Chsy1Q6ZQ11 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Chsy1Q6ZQ11 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Chsy1Q6ZQ11 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Chsy1Q6ZQ11 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Chsy1Q6ZQ11 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Chsy1Q6ZQ11 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Chsy1Q6ZQ11 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Chsy1Q6ZQ11 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Chsy1Q6ZQ11 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Chsy1Q6ZQ11 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Chsy1Q6ZQ11 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Chsy1Q6ZQ11 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Chsy1Q6ZQ11 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Chsy1Q6ZQ11 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Chsy1Q6ZQ11 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Chsy1Q6ZQ11 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Chsy1Q6ZQ11 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Chsy1Q6ZQ11 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Chsy1Q6ZQ11 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Chsy1Q6ZQ11 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Chsy1Q6ZQ11 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Chsy1Q6ZQ11 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Chsy1Q6ZQ11 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Chsy1Q6ZQ11 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Chsy1Q6ZQ11 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Chsy1Q6ZQ11 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Chsy1Q6ZQ11 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Chsy1Q6ZQ11 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Chsy1Q6ZQ11 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Chsy1Q6ZQ11 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Chsy1Q6ZQ11 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Chsy1Q6ZQ11 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Chsy1Q6ZQ11 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Chsy1Q6ZQ11 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Chsy1Q6ZQ11 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Chsy1Q6ZQ11 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Chsy1Q6ZQ11 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Chsy1Q6ZQ11 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Chsy1Q6ZQ11 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Chsy1Q6ZQ11 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Chsy1Q6ZQ11 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Chsy1Q6ZQ11 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Chsy1Q6ZQ11 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Chsy1Q6ZQ11 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Chsy1Q6ZQ11 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Chsy1Q6ZQ11 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Chsy1Q6ZQ11 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Chsy1Q6ZQ11 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Chsy1Q6ZQ11 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Chsy1Q6ZQ11 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Chsy1Q6ZQ11 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Chsy1Q6ZQ11 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Chsy1Q6ZQ11 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Chsy1Q6ZQ11 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Chsy1Q6ZQ11 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Chsy1Q6ZQ11 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Chsy1Q6ZQ11 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Chsy1Q6ZQ11 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Chsy1Q6ZQ11 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Chsy1Q6ZQ11 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Chsy1Q6ZQ11 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Chsy1Q6ZQ11 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Chsy1Q6ZQ11 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Chsy1Q6ZQ11 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Chsy1Q6ZQ11 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Chsy1Q6ZQ11 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Chsy1Q6ZQ11 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Chsy1Q6ZQ11 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Chsy1Q6ZQ11 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Chsy1Q6ZQ11 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Chsy1Q6ZQ11 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Chsy1Q6ZQ11 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Chsy1Q6ZQ11 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.5 ms