Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZPR5

Smpd4, Sphingomyelin phosphodiesterase 4, mousemouse

Predictions only

Length 823 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smpd4Q6ZPR5 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Smpd4Q6ZPR5 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Smpd4Q6ZPR5 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Smpd4Q6ZPR5 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Smpd4Q6ZPR5 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Smpd4Q6ZPR5 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Smpd4Q6ZPR5 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Smpd4Q6ZPR5 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Smpd4Q6ZPR5 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Smpd4Q6ZPR5 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Smpd4Q6ZPR5 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Smpd4Q6ZPR5 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Smpd4Q6ZPR5 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Smpd4Q6ZPR5 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Smpd4Q6ZPR5 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Smpd4Q6ZPR5 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Smpd4Q6ZPR5 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Smpd4Q6ZPR5 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Smpd4Q6ZPR5 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Smpd4Q6ZPR5 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Smpd4Q6ZPR5 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Smpd4Q6ZPR5 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Smpd4Q6ZPR5 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Smpd4Q6ZPR5 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Smpd4Q6ZPR5 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Smpd4Q6ZPR5 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Smpd4Q6ZPR5 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Smpd4Q6ZPR5 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Smpd4Q6ZPR5 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Smpd4Q6ZPR5 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Smpd4Q6ZPR5 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Smpd4Q6ZPR5 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Smpd4Q6ZPR5 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Smpd4Q6ZPR5 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Smpd4Q6ZPR5 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Smpd4Q6ZPR5 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Smpd4Q6ZPR5 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Smpd4Q6ZPR5 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Smpd4Q6ZPR5 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Smpd4Q6ZPR5 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Smpd4Q6ZPR5 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Smpd4Q6ZPR5 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Smpd4Q6ZPR5 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Smpd4Q6ZPR5 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Smpd4Q6ZPR5 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Smpd4Q6ZPR5 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Smpd4Q6ZPR5 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Smpd4Q6ZPR5 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Smpd4Q6ZPR5 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Smpd4Q6ZPR5 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Smpd4Q6ZPR5 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Smpd4Q6ZPR5 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Smpd4Q6ZPR5 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Smpd4Q6ZPR5 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Smpd4Q6ZPR5 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Smpd4Q6ZPR5 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Smpd4Q6ZPR5 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Smpd4Q6ZPR5 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Smpd4Q6ZPR5 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Smpd4Q6ZPR5 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Smpd4Q6ZPR5 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Smpd4Q6ZPR5 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Smpd4Q6ZPR5 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Smpd4Q6ZPR5 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Smpd4Q6ZPR5 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Smpd4Q6ZPR5 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Smpd4Q6ZPR5 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Smpd4Q6ZPR5 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Smpd4Q6ZPR5 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Smpd4Q6ZPR5 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Smpd4Q6ZPR5 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Smpd4Q6ZPR5 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Smpd4Q6ZPR5 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Smpd4Q6ZPR5 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Smpd4Q6ZPR5 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Smpd4Q6ZPR5 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Smpd4Q6ZPR5 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Smpd4Q6ZPR5 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Smpd4Q6ZPR5 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Smpd4Q6ZPR5 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Smpd4Q6ZPR5 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Smpd4Q6ZPR5 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Smpd4Q6ZPR5 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Smpd4Q6ZPR5 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Smpd4Q6ZPR5 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Smpd4Q6ZPR5 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Smpd4Q6ZPR5 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Smpd4Q6ZPR5 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Smpd4Q6ZPR5 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Smpd4Q6ZPR5 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Smpd4Q6ZPR5 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Smpd4Q6ZPR5 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Smpd4Q6ZPR5 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Smpd4Q6ZPR5 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Smpd4Q6ZPR5 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Smpd4Q6ZPR5 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Smpd4Q6ZPR5 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Smpd4Q6ZPR5 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Smpd4Q6ZPR5 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Smpd4Q6ZPR5 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.6 ms