Protein–RNA interactions for Protein: Q6SJQ7

Cd300lf, CMRF35-like molecule 1, mousemouse

Predictions only

Length 337 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd300lfQ6SJQ7 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Cd300lfQ6SJQ7 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Cd300lfQ6SJQ7 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Cd300lfQ6SJQ7 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Cd300lfQ6SJQ7 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Cd300lfQ6SJQ7 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Cd300lfQ6SJQ7 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Cd300lfQ6SJQ7 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Cd300lfQ6SJQ7 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Cd300lfQ6SJQ7 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Cd300lfQ6SJQ7 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Cd300lfQ6SJQ7 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Cd300lfQ6SJQ7 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Cd300lfQ6SJQ7 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Cd300lfQ6SJQ7 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Cd300lfQ6SJQ7 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Cd300lfQ6SJQ7 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Cd300lfQ6SJQ7 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Cd300lfQ6SJQ7 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Cd300lfQ6SJQ7 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Cd300lfQ6SJQ7 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Cd300lfQ6SJQ7 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Cd300lfQ6SJQ7 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Cd300lfQ6SJQ7 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Cd300lfQ6SJQ7 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Cd300lfQ6SJQ7 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Cd300lfQ6SJQ7 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Cd300lfQ6SJQ7 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
Cd300lfQ6SJQ7 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Cd300lfQ6SJQ7 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Cd300lfQ6SJQ7 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Cd300lfQ6SJQ7 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Cd300lfQ6SJQ7 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Cd300lfQ6SJQ7 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Cd300lfQ6SJQ7 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Cd300lfQ6SJQ7 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
Cd300lfQ6SJQ7 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Cd300lfQ6SJQ7 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Cd300lfQ6SJQ7 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Cd300lfQ6SJQ7 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Cd300lfQ6SJQ7 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Cd300lfQ6SJQ7 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Cd300lfQ6SJQ7 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Cd300lfQ6SJQ7 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Cd300lfQ6SJQ7 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Cd300lfQ6SJQ7 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
Cd300lfQ6SJQ7 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Cd300lfQ6SJQ7 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Cd300lfQ6SJQ7 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Cd300lfQ6SJQ7 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Cd300lfQ6SJQ7 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Cd300lfQ6SJQ7 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Cd300lfQ6SJQ7 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Cd300lfQ6SJQ7 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Cd300lfQ6SJQ7 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Cd300lfQ6SJQ7 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
Cd300lfQ6SJQ7 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Cd300lfQ6SJQ7 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Cd300lfQ6SJQ7 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
Cd300lfQ6SJQ7 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Cd300lfQ6SJQ7 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Cd300lfQ6SJQ7 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Cd300lfQ6SJQ7 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Cd300lfQ6SJQ7 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Cd300lfQ6SJQ7 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Cd300lfQ6SJQ7 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Cd300lfQ6SJQ7 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Cd300lfQ6SJQ7 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Cd300lfQ6SJQ7 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Cd300lfQ6SJQ7 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Cd300lfQ6SJQ7 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Cd300lfQ6SJQ7 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Cd300lfQ6SJQ7 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
Cd300lfQ6SJQ7 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Cd300lfQ6SJQ7 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Cd300lfQ6SJQ7 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Cd300lfQ6SJQ7 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Cd300lfQ6SJQ7 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
Cd300lfQ6SJQ7 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
Cd300lfQ6SJQ7 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Cd300lfQ6SJQ7 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Cd300lfQ6SJQ7 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Cd300lfQ6SJQ7 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Cd300lfQ6SJQ7 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Cd300lfQ6SJQ7 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Cd300lfQ6SJQ7 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Cd300lfQ6SJQ7 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Cd300lfQ6SJQ7 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Cd300lfQ6SJQ7 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Cd300lfQ6SJQ7 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
Cd300lfQ6SJQ7 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Cd300lfQ6SJQ7 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Cd300lfQ6SJQ7 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Cd300lfQ6SJQ7 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Cd300lfQ6SJQ7 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Cd300lfQ6SJQ7 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Cd300lfQ6SJQ7 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Cd300lfQ6SJQ7 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Cd300lfQ6SJQ7 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Cd300lfQ6SJQ7 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.8 ms