Protein–RNA interactions for Protein: Q6RFH4

Gcsam, Germinal center-associated signaling and motility protein, mousemouse

Predictions only

Length 181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GcsamQ6RFH4 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GcsamQ6RFH4 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GcsamQ6RFH4 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GcsamQ6RFH4 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GcsamQ6RFH4 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
GcsamQ6RFH4 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GcsamQ6RFH4 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
GcsamQ6RFH4 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GcsamQ6RFH4 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GcsamQ6RFH4 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
GcsamQ6RFH4 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GcsamQ6RFH4 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GcsamQ6RFH4 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GcsamQ6RFH4 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GcsamQ6RFH4 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GcsamQ6RFH4 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GcsamQ6RFH4 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
GcsamQ6RFH4 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GcsamQ6RFH4 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GcsamQ6RFH4 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
GcsamQ6RFH4 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
GcsamQ6RFH4 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GcsamQ6RFH4 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GcsamQ6RFH4 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
GcsamQ6RFH4 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GcsamQ6RFH4 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
GcsamQ6RFH4 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GcsamQ6RFH4 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GcsamQ6RFH4 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
GcsamQ6RFH4 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GcsamQ6RFH4 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
GcsamQ6RFH4 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GcsamQ6RFH4 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GcsamQ6RFH4 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
GcsamQ6RFH4 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GcsamQ6RFH4 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GcsamQ6RFH4 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
GcsamQ6RFH4 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GcsamQ6RFH4 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GcsamQ6RFH4 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GcsamQ6RFH4 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GcsamQ6RFH4 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
GcsamQ6RFH4 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
GcsamQ6RFH4 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
GcsamQ6RFH4 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
GcsamQ6RFH4 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
GcsamQ6RFH4 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
GcsamQ6RFH4 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
GcsamQ6RFH4 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
GcsamQ6RFH4 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
GcsamQ6RFH4 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
GcsamQ6RFH4 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
GcsamQ6RFH4 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
GcsamQ6RFH4 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
GcsamQ6RFH4 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
GcsamQ6RFH4 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
GcsamQ6RFH4 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
GcsamQ6RFH4 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
GcsamQ6RFH4 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
GcsamQ6RFH4 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
GcsamQ6RFH4 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
GcsamQ6RFH4 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
GcsamQ6RFH4 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
GcsamQ6RFH4 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
GcsamQ6RFH4 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
GcsamQ6RFH4 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GcsamQ6RFH4 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GcsamQ6RFH4 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
GcsamQ6RFH4 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GcsamQ6RFH4 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GcsamQ6RFH4 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GcsamQ6RFH4 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GcsamQ6RFH4 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GcsamQ6RFH4 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GcsamQ6RFH4 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GcsamQ6RFH4 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GcsamQ6RFH4 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GcsamQ6RFH4 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GcsamQ6RFH4 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GcsamQ6RFH4 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GcsamQ6RFH4 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GcsamQ6RFH4 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GcsamQ6RFH4 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GcsamQ6RFH4 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GcsamQ6RFH4 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GcsamQ6RFH4 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GcsamQ6RFH4 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GcsamQ6RFH4 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GcsamQ6RFH4 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GcsamQ6RFH4 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
GcsamQ6RFH4 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GcsamQ6RFH4 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GcsamQ6RFH4 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
GcsamQ6RFH4 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
GcsamQ6RFH4 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GcsamQ6RFH4 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GcsamQ6RFH4 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GcsamQ6RFH4 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GcsamQ6RFH4 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GcsamQ6RFH4 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.8 ms