Protein–RNA interactions for Protein: Q6R2P8

Neil2, Endonuclease 8-like 2, mousemouse

Predictions only

Length 329 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Neil2Q6R2P8 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Neil2Q6R2P8 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Neil2Q6R2P8 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Neil2Q6R2P8 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Neil2Q6R2P8 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Neil2Q6R2P8 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Neil2Q6R2P8 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Neil2Q6R2P8 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Neil2Q6R2P8 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Neil2Q6R2P8 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Neil2Q6R2P8 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Neil2Q6R2P8 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Neil2Q6R2P8 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Neil2Q6R2P8 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Neil2Q6R2P8 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Neil2Q6R2P8 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Neil2Q6R2P8 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Neil2Q6R2P8 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Neil2Q6R2P8 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Neil2Q6R2P8 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Neil2Q6R2P8 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Neil2Q6R2P8 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Neil2Q6R2P8 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Neil2Q6R2P8 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Neil2Q6R2P8 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Neil2Q6R2P8 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Neil2Q6R2P8 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Neil2Q6R2P8 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Neil2Q6R2P8 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Neil2Q6R2P8 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Neil2Q6R2P8 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Neil2Q6R2P8 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Neil2Q6R2P8 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Neil2Q6R2P8 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Neil2Q6R2P8 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Neil2Q6R2P8 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Neil2Q6R2P8 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Neil2Q6R2P8 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Neil2Q6R2P8 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Neil2Q6R2P8 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Neil2Q6R2P8 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Neil2Q6R2P8 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Neil2Q6R2P8 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Neil2Q6R2P8 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Neil2Q6R2P8 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Neil2Q6R2P8 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Neil2Q6R2P8 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Neil2Q6R2P8 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Neil2Q6R2P8 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Neil2Q6R2P8 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Neil2Q6R2P8 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Neil2Q6R2P8 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Neil2Q6R2P8 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Neil2Q6R2P8 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Neil2Q6R2P8 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Neil2Q6R2P8 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Neil2Q6R2P8 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Neil2Q6R2P8 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Neil2Q6R2P8 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Neil2Q6R2P8 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Neil2Q6R2P8 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Neil2Q6R2P8 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Neil2Q6R2P8 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Neil2Q6R2P8 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Neil2Q6R2P8 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Neil2Q6R2P8 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Neil2Q6R2P8 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Neil2Q6R2P8 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Neil2Q6R2P8 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Neil2Q6R2P8 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Neil2Q6R2P8 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Neil2Q6R2P8 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Neil2Q6R2P8 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Neil2Q6R2P8 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Neil2Q6R2P8 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Neil2Q6R2P8 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Neil2Q6R2P8 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Neil2Q6R2P8 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Neil2Q6R2P8 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Neil2Q6R2P8 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Neil2Q6R2P8 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Neil2Q6R2P8 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Neil2Q6R2P8 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Neil2Q6R2P8 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Neil2Q6R2P8 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Neil2Q6R2P8 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Neil2Q6R2P8 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Neil2Q6R2P8 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Neil2Q6R2P8 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Neil2Q6R2P8 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Neil2Q6R2P8 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Neil2Q6R2P8 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Neil2Q6R2P8 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Neil2Q6R2P8 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Neil2Q6R2P8 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Neil2Q6R2P8 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Neil2Q6R2P8 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Neil2Q6R2P8 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Neil2Q6R2P8 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Neil2Q6R2P8 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.9 ms