Protein–RNA interactions for Protein: Q6PGF5

Bms1, BMS1 homolog, ribosome assembly protein (Yeast), mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,284 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bms1Q6PGF5 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Bms1Q6PGF5 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Bms1Q6PGF5 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Bms1Q6PGF5 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Bms1Q6PGF5 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Bms1Q6PGF5 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Bms1Q6PGF5 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Bms1Q6PGF5 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Bms1Q6PGF5 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Bms1Q6PGF5 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Bms1Q6PGF5 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Bms1Q6PGF5 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Bms1Q6PGF5 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Bms1Q6PGF5 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Bms1Q6PGF5 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Bms1Q6PGF5 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Bms1Q6PGF5 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Bms1Q6PGF5 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Bms1Q6PGF5 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Bms1Q6PGF5 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Bms1Q6PGF5 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Bms1Q6PGF5 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Bms1Q6PGF5 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Bms1Q6PGF5 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Bms1Q6PGF5 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Bms1Q6PGF5 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Bms1Q6PGF5 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Bms1Q6PGF5 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Bms1Q6PGF5 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Bms1Q6PGF5 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Bms1Q6PGF5 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Bms1Q6PGF5 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Bms1Q6PGF5 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Bms1Q6PGF5 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Bms1Q6PGF5 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Bms1Q6PGF5 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Bms1Q6PGF5 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Bms1Q6PGF5 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Bms1Q6PGF5 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Bms1Q6PGF5 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Bms1Q6PGF5 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Bms1Q6PGF5 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Bms1Q6PGF5 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Bms1Q6PGF5 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Bms1Q6PGF5 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Bms1Q6PGF5 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Bms1Q6PGF5 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Bms1Q6PGF5 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Bms1Q6PGF5 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Bms1Q6PGF5 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Bms1Q6PGF5 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Bms1Q6PGF5 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Bms1Q6PGF5 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Bms1Q6PGF5 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Bms1Q6PGF5 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Bms1Q6PGF5 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Bms1Q6PGF5 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Bms1Q6PGF5 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Bms1Q6PGF5 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Bms1Q6PGF5 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Bms1Q6PGF5 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Bms1Q6PGF5 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Bms1Q6PGF5 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Bms1Q6PGF5 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Bms1Q6PGF5 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Bms1Q6PGF5 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Bms1Q6PGF5 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Bms1Q6PGF5 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Bms1Q6PGF5 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Bms1Q6PGF5 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Bms1Q6PGF5 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Bms1Q6PGF5 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Bms1Q6PGF5 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Bms1Q6PGF5 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Bms1Q6PGF5 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Bms1Q6PGF5 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Bms1Q6PGF5 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Bms1Q6PGF5 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Bms1Q6PGF5 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Bms1Q6PGF5 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Bms1Q6PGF5 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Bms1Q6PGF5 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Bms1Q6PGF5 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Bms1Q6PGF5 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Bms1Q6PGF5 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Bms1Q6PGF5 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Bms1Q6PGF5 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Bms1Q6PGF5 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Bms1Q6PGF5 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Bms1Q6PGF5 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Bms1Q6PGF5 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Bms1Q6PGF5 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Bms1Q6PGF5 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Bms1Q6PGF5 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Bms1Q6PGF5 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Bms1Q6PGF5 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Bms1Q6PGF5 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Bms1Q6PGF5 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Bms1Q6PGF5 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Bms1Q6PGF5 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.2 ms