Protein–RNA interactions for Protein: Q6PFE3

Rad54b, DNA repair and recombination protein RAD54B, mousemouse

Predictions only

Length 886 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rad54bQ6PFE3 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Rad54bQ6PFE3 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Rad54bQ6PFE3 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Rad54bQ6PFE3 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Rad54bQ6PFE3 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Rad54bQ6PFE3 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Rad54bQ6PFE3 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rad54bQ6PFE3 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Rad54bQ6PFE3 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rad54bQ6PFE3 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rad54bQ6PFE3 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rad54bQ6PFE3 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rad54bQ6PFE3 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rad54bQ6PFE3 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rad54bQ6PFE3 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rad54bQ6PFE3 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rad54bQ6PFE3 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rad54bQ6PFE3 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rad54bQ6PFE3 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rad54bQ6PFE3 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rad54bQ6PFE3 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rad54bQ6PFE3 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rad54bQ6PFE3 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rad54bQ6PFE3 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rad54bQ6PFE3 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rad54bQ6PFE3 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rad54bQ6PFE3 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rad54bQ6PFE3 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rad54bQ6PFE3 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rad54bQ6PFE3 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rad54bQ6PFE3 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rad54bQ6PFE3 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rad54bQ6PFE3 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rad54bQ6PFE3 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rad54bQ6PFE3 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rad54bQ6PFE3 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rad54bQ6PFE3 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rad54bQ6PFE3 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rad54bQ6PFE3 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rad54bQ6PFE3 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rad54bQ6PFE3 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rad54bQ6PFE3 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rad54bQ6PFE3 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rad54bQ6PFE3 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rad54bQ6PFE3 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rad54bQ6PFE3 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rad54bQ6PFE3 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rad54bQ6PFE3 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rad54bQ6PFE3 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rad54bQ6PFE3 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rad54bQ6PFE3 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rad54bQ6PFE3 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rad54bQ6PFE3 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rad54bQ6PFE3 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rad54bQ6PFE3 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rad54bQ6PFE3 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rad54bQ6PFE3 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rad54bQ6PFE3 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rad54bQ6PFE3 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rad54bQ6PFE3 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rad54bQ6PFE3 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rad54bQ6PFE3 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rad54bQ6PFE3 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rad54bQ6PFE3 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rad54bQ6PFE3 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rad54bQ6PFE3 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rad54bQ6PFE3 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rad54bQ6PFE3 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rad54bQ6PFE3 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rad54bQ6PFE3 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rad54bQ6PFE3 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rad54bQ6PFE3 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rad54bQ6PFE3 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rad54bQ6PFE3 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rad54bQ6PFE3 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rad54bQ6PFE3 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rad54bQ6PFE3 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rad54bQ6PFE3 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rad54bQ6PFE3 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rad54bQ6PFE3 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rad54bQ6PFE3 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rad54bQ6PFE3 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rad54bQ6PFE3 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rad54bQ6PFE3 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rad54bQ6PFE3 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rad54bQ6PFE3 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Rad54bQ6PFE3 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rad54bQ6PFE3 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rad54bQ6PFE3 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rad54bQ6PFE3 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rad54bQ6PFE3 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rad54bQ6PFE3 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rad54bQ6PFE3 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rad54bQ6PFE3 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rad54bQ6PFE3 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rad54bQ6PFE3 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rad54bQ6PFE3 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rad54bQ6PFE3 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rad54bQ6PFE3 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rad54bQ6PFE3 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.8 ms