Protein–RNA interactions for Protein: Q6PEM8

Slc46a1, Proton-coupled folate transporter, mousemouse

Predictions only

Length 459 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc46a1Q6PEM8 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Slc46a1Q6PEM8 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Slc46a1Q6PEM8 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Slc46a1Q6PEM8 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Slc46a1Q6PEM8 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Slc46a1Q6PEM8 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Slc46a1Q6PEM8 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Slc46a1Q6PEM8 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Slc46a1Q6PEM8 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Slc46a1Q6PEM8 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Slc46a1Q6PEM8 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Slc46a1Q6PEM8 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Slc46a1Q6PEM8 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Slc46a1Q6PEM8 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Slc46a1Q6PEM8 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Slc46a1Q6PEM8 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Slc46a1Q6PEM8 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Slc46a1Q6PEM8 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Slc46a1Q6PEM8 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Slc46a1Q6PEM8 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Slc46a1Q6PEM8 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Slc46a1Q6PEM8 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Slc46a1Q6PEM8 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Slc46a1Q6PEM8 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Slc46a1Q6PEM8 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Slc46a1Q6PEM8 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Slc46a1Q6PEM8 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Slc46a1Q6PEM8 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Slc46a1Q6PEM8 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Slc46a1Q6PEM8 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Slc46a1Q6PEM8 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Slc46a1Q6PEM8 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Slc46a1Q6PEM8 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Slc46a1Q6PEM8 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Slc46a1Q6PEM8 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Slc46a1Q6PEM8 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Slc46a1Q6PEM8 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Slc46a1Q6PEM8 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Slc46a1Q6PEM8 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Slc46a1Q6PEM8 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Slc46a1Q6PEM8 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Slc46a1Q6PEM8 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Slc46a1Q6PEM8 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Slc46a1Q6PEM8 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Slc46a1Q6PEM8 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Slc46a1Q6PEM8 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Slc46a1Q6PEM8 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Slc46a1Q6PEM8 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Slc46a1Q6PEM8 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Slc46a1Q6PEM8 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Slc46a1Q6PEM8 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Slc46a1Q6PEM8 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Slc46a1Q6PEM8 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Slc46a1Q6PEM8 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Slc46a1Q6PEM8 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Slc46a1Q6PEM8 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Slc46a1Q6PEM8 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Slc46a1Q6PEM8 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Slc46a1Q6PEM8 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Slc46a1Q6PEM8 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Slc46a1Q6PEM8 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Slc46a1Q6PEM8 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Slc46a1Q6PEM8 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Slc46a1Q6PEM8 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Slc46a1Q6PEM8 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Slc46a1Q6PEM8 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Slc46a1Q6PEM8 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Slc46a1Q6PEM8 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Slc46a1Q6PEM8 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Slc46a1Q6PEM8 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Slc46a1Q6PEM8 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Slc46a1Q6PEM8 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Slc46a1Q6PEM8 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Slc46a1Q6PEM8 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Slc46a1Q6PEM8 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Slc46a1Q6PEM8 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Slc46a1Q6PEM8 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Slc46a1Q6PEM8 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Slc46a1Q6PEM8 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Slc46a1Q6PEM8 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Slc46a1Q6PEM8 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Slc46a1Q6PEM8 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Slc46a1Q6PEM8 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Slc46a1Q6PEM8 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Slc46a1Q6PEM8 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Slc46a1Q6PEM8 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Slc46a1Q6PEM8 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Slc46a1Q6PEM8 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Slc46a1Q6PEM8 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Slc46a1Q6PEM8 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Slc46a1Q6PEM8 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Slc46a1Q6PEM8 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Slc46a1Q6PEM8 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Slc46a1Q6PEM8 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Slc46a1Q6PEM8 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Slc46a1Q6PEM8 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Slc46a1Q6PEM8 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Slc46a1Q6PEM8 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Slc46a1Q6PEM8 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Slc46a1Q6PEM8 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.5 ms