Protein–RNA interactions for Protein: Q6PEM6

Gramd2b, GRAM domain-containing protein 2B, mousemouse

Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gramd2bQ6PEM6 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Gramd2bQ6PEM6 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Gramd2bQ6PEM6 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Gramd2bQ6PEM6 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Gramd2bQ6PEM6 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Gramd2bQ6PEM6 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Gramd2bQ6PEM6 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Gramd2bQ6PEM6 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Gramd2bQ6PEM6 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Gramd2bQ6PEM6 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gramd2bQ6PEM6 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gramd2bQ6PEM6 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gramd2bQ6PEM6 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gramd2bQ6PEM6 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gramd2bQ6PEM6 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gramd2bQ6PEM6 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gramd2bQ6PEM6 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gramd2bQ6PEM6 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gramd2bQ6PEM6 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gramd2bQ6PEM6 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gramd2bQ6PEM6 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gramd2bQ6PEM6 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gramd2bQ6PEM6 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gramd2bQ6PEM6 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gramd2bQ6PEM6 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gramd2bQ6PEM6 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gramd2bQ6PEM6 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gramd2bQ6PEM6 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gramd2bQ6PEM6 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gramd2bQ6PEM6 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gramd2bQ6PEM6 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gramd2bQ6PEM6 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gramd2bQ6PEM6 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gramd2bQ6PEM6 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gramd2bQ6PEM6 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gramd2bQ6PEM6 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Gramd2bQ6PEM6 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gramd2bQ6PEM6 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gramd2bQ6PEM6 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gramd2bQ6PEM6 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gramd2bQ6PEM6 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gramd2bQ6PEM6 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gramd2bQ6PEM6 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gramd2bQ6PEM6 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gramd2bQ6PEM6 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gramd2bQ6PEM6 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gramd2bQ6PEM6 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gramd2bQ6PEM6 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gramd2bQ6PEM6 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gramd2bQ6PEM6 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gramd2bQ6PEM6 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gramd2bQ6PEM6 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gramd2bQ6PEM6 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gramd2bQ6PEM6 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gramd2bQ6PEM6 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gramd2bQ6PEM6 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gramd2bQ6PEM6 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gramd2bQ6PEM6 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gramd2bQ6PEM6 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gramd2bQ6PEM6 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gramd2bQ6PEM6 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gramd2bQ6PEM6 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gramd2bQ6PEM6 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gramd2bQ6PEM6 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gramd2bQ6PEM6 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gramd2bQ6PEM6 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gramd2bQ6PEM6 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gramd2bQ6PEM6 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gramd2bQ6PEM6 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gramd2bQ6PEM6 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gramd2bQ6PEM6 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gramd2bQ6PEM6 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gramd2bQ6PEM6 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gramd2bQ6PEM6 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gramd2bQ6PEM6 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gramd2bQ6PEM6 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gramd2bQ6PEM6 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gramd2bQ6PEM6 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gramd2bQ6PEM6 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gramd2bQ6PEM6 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gramd2bQ6PEM6 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gramd2bQ6PEM6 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gramd2bQ6PEM6 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Gramd2bQ6PEM6 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Gramd2bQ6PEM6 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Gramd2bQ6PEM6 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Gramd2bQ6PEM6 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Gramd2bQ6PEM6 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Gramd2bQ6PEM6 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Gramd2bQ6PEM6 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Gramd2bQ6PEM6 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Gramd2bQ6PEM6 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Gramd2bQ6PEM6 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Gramd2bQ6PEM6 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gramd2bQ6PEM6 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gramd2bQ6PEM6 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gramd2bQ6PEM6 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gramd2bQ6PEM6 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gramd2bQ6PEM6 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gramd2bQ6PEM6 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16 ms