Protein–RNA interactions for Protein: Q6PDM4

Ccdc36, Interactor of HORMAD1 protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 574 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc36Q6PDM4 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ccdc36Q6PDM4 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ccdc36Q6PDM4 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ccdc36Q6PDM4 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ccdc36Q6PDM4 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ccdc36Q6PDM4 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ccdc36Q6PDM4 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ccdc36Q6PDM4 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ccdc36Q6PDM4 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ccdc36Q6PDM4 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ccdc36Q6PDM4 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ccdc36Q6PDM4 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ccdc36Q6PDM4 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ccdc36Q6PDM4 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ccdc36Q6PDM4 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ccdc36Q6PDM4 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ccdc36Q6PDM4 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ccdc36Q6PDM4 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ccdc36Q6PDM4 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ccdc36Q6PDM4 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ccdc36Q6PDM4 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ccdc36Q6PDM4 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ccdc36Q6PDM4 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ccdc36Q6PDM4 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ccdc36Q6PDM4 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ccdc36Q6PDM4 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ccdc36Q6PDM4 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccdc36Q6PDM4 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccdc36Q6PDM4 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccdc36Q6PDM4 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccdc36Q6PDM4 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccdc36Q6PDM4 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccdc36Q6PDM4 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccdc36Q6PDM4 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccdc36Q6PDM4 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccdc36Q6PDM4 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccdc36Q6PDM4 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccdc36Q6PDM4 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccdc36Q6PDM4 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccdc36Q6PDM4 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccdc36Q6PDM4 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccdc36Q6PDM4 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc36Q6PDM4 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc36Q6PDM4 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc36Q6PDM4 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc36Q6PDM4 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc36Q6PDM4 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc36Q6PDM4 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc36Q6PDM4 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc36Q6PDM4 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc36Q6PDM4 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc36Q6PDM4 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc36Q6PDM4 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc36Q6PDM4 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc36Q6PDM4 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc36Q6PDM4 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc36Q6PDM4 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc36Q6PDM4 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc36Q6PDM4 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc36Q6PDM4 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc36Q6PDM4 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc36Q6PDM4 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc36Q6PDM4 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc36Q6PDM4 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc36Q6PDM4 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc36Q6PDM4 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc36Q6PDM4 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc36Q6PDM4 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc36Q6PDM4 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc36Q6PDM4 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc36Q6PDM4 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc36Q6PDM4 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc36Q6PDM4 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc36Q6PDM4 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc36Q6PDM4 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc36Q6PDM4 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc36Q6PDM4 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc36Q6PDM4 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc36Q6PDM4 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc36Q6PDM4 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc36Q6PDM4 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc36Q6PDM4 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc36Q6PDM4 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc36Q6PDM4 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc36Q6PDM4 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc36Q6PDM4 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc36Q6PDM4 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc36Q6PDM4 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc36Q6PDM4 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc36Q6PDM4 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc36Q6PDM4 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc36Q6PDM4 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc36Q6PDM4 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc36Q6PDM4 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc36Q6PDM4 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc36Q6PDM4 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc36Q6PDM4 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc36Q6PDM4 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc36Q6PDM4 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc36Q6PDM4 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33 ms