Protein–RNA interactions for Protein: Q6P5U8

Ccdc148, Coiled-coil domain-containing protein 148, mousemouse

Predictions only

Length 527 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc148Q6P5U8 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ccdc148Q6P5U8 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ccdc148Q6P5U8 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ccdc148Q6P5U8 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ccdc148Q6P5U8 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ccdc148Q6P5U8 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ccdc148Q6P5U8 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ccdc148Q6P5U8 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ccdc148Q6P5U8 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ccdc148Q6P5U8 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ccdc148Q6P5U8 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ccdc148Q6P5U8 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ccdc148Q6P5U8 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ccdc148Q6P5U8 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ccdc148Q6P5U8 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ccdc148Q6P5U8 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ccdc148Q6P5U8 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ccdc148Q6P5U8 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ccdc148Q6P5U8 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ccdc148Q6P5U8 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ccdc148Q6P5U8 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ccdc148Q6P5U8 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Ccdc148Q6P5U8 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ccdc148Q6P5U8 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ccdc148Q6P5U8 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ccdc148Q6P5U8 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ccdc148Q6P5U8 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ccdc148Q6P5U8 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ccdc148Q6P5U8 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Ccdc148Q6P5U8 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ccdc148Q6P5U8 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ccdc148Q6P5U8 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Ccdc148Q6P5U8 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Ccdc148Q6P5U8 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Ccdc148Q6P5U8 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ccdc148Q6P5U8 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ccdc148Q6P5U8 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ccdc148Q6P5U8 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ccdc148Q6P5U8 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ccdc148Q6P5U8 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ccdc148Q6P5U8 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ccdc148Q6P5U8 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ccdc148Q6P5U8 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Ccdc148Q6P5U8 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ccdc148Q6P5U8 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ccdc148Q6P5U8 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ccdc148Q6P5U8 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ccdc148Q6P5U8 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ccdc148Q6P5U8 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ccdc148Q6P5U8 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ccdc148Q6P5U8 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ccdc148Q6P5U8 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ccdc148Q6P5U8 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ccdc148Q6P5U8 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ccdc148Q6P5U8 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ccdc148Q6P5U8 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ccdc148Q6P5U8 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ccdc148Q6P5U8 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ccdc148Q6P5U8 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ccdc148Q6P5U8 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ccdc148Q6P5U8 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ccdc148Q6P5U8 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ccdc148Q6P5U8 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ccdc148Q6P5U8 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ccdc148Q6P5U8 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ccdc148Q6P5U8 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ccdc148Q6P5U8 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ccdc148Q6P5U8 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ccdc148Q6P5U8 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ccdc148Q6P5U8 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ccdc148Q6P5U8 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ccdc148Q6P5U8 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ccdc148Q6P5U8 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ccdc148Q6P5U8 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ccdc148Q6P5U8 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ccdc148Q6P5U8 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ccdc148Q6P5U8 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ccdc148Q6P5U8 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ccdc148Q6P5U8 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ccdc148Q6P5U8 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ccdc148Q6P5U8 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ccdc148Q6P5U8 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ccdc148Q6P5U8 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Ccdc148Q6P5U8 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ccdc148Q6P5U8 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Ccdc148Q6P5U8 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Ccdc148Q6P5U8 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ccdc148Q6P5U8 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ccdc148Q6P5U8 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ccdc148Q6P5U8 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ccdc148Q6P5U8 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ccdc148Q6P5U8 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ccdc148Q6P5U8 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ccdc148Q6P5U8 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ccdc148Q6P5U8 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ccdc148Q6P5U8 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ccdc148Q6P5U8 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ccdc148Q6P5U8 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ccdc148Q6P5U8 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ccdc148Q6P5U8 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.8 ms