Protein–RNA interactions for Protein: Q6NXK8

Asic1, Acid-sensing ion channel 1, mousemouse

Predictions only

Length 526 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Asic1Q6NXK8 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Asic1Q6NXK8 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Asic1Q6NXK8 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Asic1Q6NXK8 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Asic1Q6NXK8 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Asic1Q6NXK8 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Asic1Q6NXK8 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Asic1Q6NXK8 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Asic1Q6NXK8 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Asic1Q6NXK8 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Asic1Q6NXK8 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Asic1Q6NXK8 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Asic1Q6NXK8 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Asic1Q6NXK8 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Asic1Q6NXK8 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Asic1Q6NXK8 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Asic1Q6NXK8 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Asic1Q6NXK8 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Asic1Q6NXK8 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Asic1Q6NXK8 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Asic1Q6NXK8 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Asic1Q6NXK8 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Asic1Q6NXK8 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Asic1Q6NXK8 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Asic1Q6NXK8 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Asic1Q6NXK8 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Asic1Q6NXK8 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Asic1Q6NXK8 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Asic1Q6NXK8 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Asic1Q6NXK8 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Asic1Q6NXK8 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Asic1Q6NXK8 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Asic1Q6NXK8 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Asic1Q6NXK8 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Asic1Q6NXK8 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Asic1Q6NXK8 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Asic1Q6NXK8 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Asic1Q6NXK8 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Asic1Q6NXK8 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Asic1Q6NXK8 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Asic1Q6NXK8 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Asic1Q6NXK8 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Asic1Q6NXK8 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.87
Asic1Q6NXK8 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.87
Asic1Q6NXK8 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Asic1Q6NXK8 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Asic1Q6NXK8 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Asic1Q6NXK8 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Asic1Q6NXK8 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Asic1Q6NXK8 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Asic1Q6NXK8 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Asic1Q6NXK8 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Asic1Q6NXK8 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Asic1Q6NXK8 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Asic1Q6NXK8 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Asic1Q6NXK8 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Asic1Q6NXK8 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Asic1Q6NXK8 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Asic1Q6NXK8 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Asic1Q6NXK8 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Asic1Q6NXK8 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Asic1Q6NXK8 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Asic1Q6NXK8 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Asic1Q6NXK8 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Asic1Q6NXK8 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Asic1Q6NXK8 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Asic1Q6NXK8 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Asic1Q6NXK8 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Asic1Q6NXK8 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Asic1Q6NXK8 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Asic1Q6NXK8 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Asic1Q6NXK8 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Asic1Q6NXK8 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Asic1Q6NXK8 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Asic1Q6NXK8 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Asic1Q6NXK8 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Asic1Q6NXK8 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Asic1Q6NXK8 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Asic1Q6NXK8 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Asic1Q6NXK8 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Asic1Q6NXK8 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Asic1Q6NXK8 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Asic1Q6NXK8 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Asic1Q6NXK8 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Asic1Q6NXK8 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Asic1Q6NXK8 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Asic1Q6NXK8 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Asic1Q6NXK8 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Asic1Q6NXK8 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Asic1Q6NXK8 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Asic1Q6NXK8 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Asic1Q6NXK8 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Asic1Q6NXK8 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Asic1Q6NXK8 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Asic1Q6NXK8 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Asic1Q6NXK8 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Asic1Q6NXK8 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Asic1Q6NXK8 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Asic1Q6NXK8 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Asic1Q6NXK8 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.7 ms