Protein–RNA interactions for Protein: Q6NXH3

Gpbp1, Vasculin, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gpbp1Q6NXH3 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Gpbp1Q6NXH3 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Gpbp1Q6NXH3 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Gpbp1Q6NXH3 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Gpbp1Q6NXH3 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Gpbp1Q6NXH3 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Gpbp1Q6NXH3 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Gpbp1Q6NXH3 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Gpbp1Q6NXH3 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Gpbp1Q6NXH3 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Gpbp1Q6NXH3 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Gpbp1Q6NXH3 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Gpbp1Q6NXH3 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Gpbp1Q6NXH3 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
Gpbp1Q6NXH3 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Gpbp1Q6NXH3 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Gpbp1Q6NXH3 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Gpbp1Q6NXH3 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Gpbp1Q6NXH3 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Gpbp1Q6NXH3 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Gpbp1Q6NXH3 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
Gpbp1Q6NXH3 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Gpbp1Q6NXH3 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
Gpbp1Q6NXH3 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Gpbp1Q6NXH3 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Gpbp1Q6NXH3 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Gpbp1Q6NXH3 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Gpbp1Q6NXH3 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Gpbp1Q6NXH3 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Gpbp1Q6NXH3 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Gpbp1Q6NXH3 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Gpbp1Q6NXH3 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Gpbp1Q6NXH3 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Gpbp1Q6NXH3 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Gpbp1Q6NXH3 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Gpbp1Q6NXH3 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Gpbp1Q6NXH3 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Gpbp1Q6NXH3 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Gpbp1Q6NXH3 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Gpbp1Q6NXH3 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Gpbp1Q6NXH3 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Gpbp1Q6NXH3 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Gpbp1Q6NXH3 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Gpbp1Q6NXH3 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
Gpbp1Q6NXH3 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Gpbp1Q6NXH3 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Gpbp1Q6NXH3 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Gpbp1Q6NXH3 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
Gpbp1Q6NXH3 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
Gpbp1Q6NXH3 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Gpbp1Q6NXH3 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Gpbp1Q6NXH3 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Gpbp1Q6NXH3 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Gpbp1Q6NXH3 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Gpbp1Q6NXH3 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Gpbp1Q6NXH3 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Gpbp1Q6NXH3 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Gpbp1Q6NXH3 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Gpbp1Q6NXH3 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Gpbp1Q6NXH3 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Gpbp1Q6NXH3 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Gpbp1Q6NXH3 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Gpbp1Q6NXH3 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Gpbp1Q6NXH3 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Gpbp1Q6NXH3 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Gpbp1Q6NXH3 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Gpbp1Q6NXH3 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Gpbp1Q6NXH3 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Gpbp1Q6NXH3 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Gpbp1Q6NXH3 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Gpbp1Q6NXH3 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Gpbp1Q6NXH3 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Gpbp1Q6NXH3 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Gpbp1Q6NXH3 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Gpbp1Q6NXH3 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Gpbp1Q6NXH3 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Gpbp1Q6NXH3 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Gpbp1Q6NXH3 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Gpbp1Q6NXH3 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Gpbp1Q6NXH3 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Gpbp1Q6NXH3 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
Gpbp1Q6NXH3 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Gpbp1Q6NXH3 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Gpbp1Q6NXH3 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Gpbp1Q6NXH3 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Gpbp1Q6NXH3 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Gpbp1Q6NXH3 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Gpbp1Q6NXH3 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Gpbp1Q6NXH3 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Gpbp1Q6NXH3 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Gpbp1Q6NXH3 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Gpbp1Q6NXH3 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Gpbp1Q6NXH3 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Gpbp1Q6NXH3 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Gpbp1Q6NXH3 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Gpbp1Q6NXH3 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Gpbp1Q6NXH3 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Gpbp1Q6NXH3 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Gpbp1Q6NXH3 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Gpbp1Q6NXH3 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.9 ms