Protein–RNA interactions for Protein: Q6IFX3

Krt40, Keratin, type I cytoskeletal 40, mousemouse

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Length 439 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt40Q6IFX3 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Krt40Q6IFX3 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Krt40Q6IFX3 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Krt40Q6IFX3 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Krt40Q6IFX3 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Krt40Q6IFX3 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Krt40Q6IFX3 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Krt40Q6IFX3 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Krt40Q6IFX3 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Krt40Q6IFX3 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Krt40Q6IFX3 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Krt40Q6IFX3 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Krt40Q6IFX3 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
Krt40Q6IFX3 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Krt40Q6IFX3 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Krt40Q6IFX3 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Krt40Q6IFX3 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Krt40Q6IFX3 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Krt40Q6IFX3 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Krt40Q6IFX3 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Krt40Q6IFX3 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Krt40Q6IFX3 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Krt40Q6IFX3 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Krt40Q6IFX3 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
Krt40Q6IFX3 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Krt40Q6IFX3 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Krt40Q6IFX3 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Krt40Q6IFX3 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Krt40Q6IFX3 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Krt40Q6IFX3 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
Krt40Q6IFX3 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
Krt40Q6IFX3 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
Krt40Q6IFX3 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Krt40Q6IFX3 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Krt40Q6IFX3 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Krt40Q6IFX3 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Krt40Q6IFX3 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Krt40Q6IFX3 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
Krt40Q6IFX3 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Krt40Q6IFX3 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Krt40Q6IFX3 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Krt40Q6IFX3 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Krt40Q6IFX3 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Krt40Q6IFX3 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Krt40Q6IFX3 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Krt40Q6IFX3 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Krt40Q6IFX3 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Krt40Q6IFX3 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Krt40Q6IFX3 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Krt40Q6IFX3 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Krt40Q6IFX3 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Krt40Q6IFX3 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Krt40Q6IFX3 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Krt40Q6IFX3 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Krt40Q6IFX3 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Krt40Q6IFX3 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Krt40Q6IFX3 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Krt40Q6IFX3 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Krt40Q6IFX3 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Krt40Q6IFX3 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Krt40Q6IFX3 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Krt40Q6IFX3 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Krt40Q6IFX3 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Krt40Q6IFX3 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Krt40Q6IFX3 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Krt40Q6IFX3 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Krt40Q6IFX3 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Krt40Q6IFX3 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
Krt40Q6IFX3 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Krt40Q6IFX3 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Krt40Q6IFX3 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Krt40Q6IFX3 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Krt40Q6IFX3 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Krt40Q6IFX3 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Krt40Q6IFX3 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Krt40Q6IFX3 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Krt40Q6IFX3 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Krt40Q6IFX3 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
Krt40Q6IFX3 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Krt40Q6IFX3 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Krt40Q6IFX3 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
Krt40Q6IFX3 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Krt40Q6IFX3 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Krt40Q6IFX3 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Krt40Q6IFX3 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Krt40Q6IFX3 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Krt40Q6IFX3 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Krt40Q6IFX3 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Krt40Q6IFX3 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Krt40Q6IFX3 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Krt40Q6IFX3 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Krt40Q6IFX3 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Krt40Q6IFX3 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Krt40Q6IFX3 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Krt40Q6IFX3 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Krt40Q6IFX3 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Krt40Q6IFX3 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Krt40Q6IFX3 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Krt40Q6IFX3 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Krt40Q6IFX3 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
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