Protein–RNA interactions for Protein: Q6DFW4

Nop58, Nucleolar protein 58, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 536 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nop58Q6DFW4 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Nop58Q6DFW4 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Nop58Q6DFW4 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Nop58Q6DFW4 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Nop58Q6DFW4 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Nop58Q6DFW4 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Nop58Q6DFW4 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Nop58Q6DFW4 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Nop58Q6DFW4 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Nop58Q6DFW4 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Nop58Q6DFW4 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Nop58Q6DFW4 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Nop58Q6DFW4 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Nop58Q6DFW4 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Nop58Q6DFW4 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Nop58Q6DFW4 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Nop58Q6DFW4 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Nop58Q6DFW4 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Nop58Q6DFW4 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
Nop58Q6DFW4 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Nop58Q6DFW4 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Nop58Q6DFW4 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Nop58Q6DFW4 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Nop58Q6DFW4 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Nop58Q6DFW4 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Nop58Q6DFW4 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
Nop58Q6DFW4 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
Nop58Q6DFW4 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Nop58Q6DFW4 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Nop58Q6DFW4 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Nop58Q6DFW4 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Nop58Q6DFW4 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Nop58Q6DFW4 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Nop58Q6DFW4 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Nop58Q6DFW4 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Nop58Q6DFW4 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Nop58Q6DFW4 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Nop58Q6DFW4 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Nop58Q6DFW4 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Nop58Q6DFW4 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Nop58Q6DFW4 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Nop58Q6DFW4 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Nop58Q6DFW4 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Nop58Q6DFW4 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Nop58Q6DFW4 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Nop58Q6DFW4 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Nop58Q6DFW4 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Nop58Q6DFW4 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.64
Nop58Q6DFW4 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
Nop58Q6DFW4 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
Nop58Q6DFW4 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Nop58Q6DFW4 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Nop58Q6DFW4 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Nop58Q6DFW4 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Nop58Q6DFW4 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Nop58Q6DFW4 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Nop58Q6DFW4 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Nop58Q6DFW4 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Nop58Q6DFW4 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Nop58Q6DFW4 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Nop58Q6DFW4 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Nop58Q6DFW4 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Nop58Q6DFW4 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Nop58Q6DFW4 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Nop58Q6DFW4 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Nop58Q6DFW4 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Nop58Q6DFW4 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Nop58Q6DFW4 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Nop58Q6DFW4 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Nop58Q6DFW4 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Nop58Q6DFW4 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Nop58Q6DFW4 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Nop58Q6DFW4 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Nop58Q6DFW4 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
Nop58Q6DFW4 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Nop58Q6DFW4 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Nop58Q6DFW4 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Nop58Q6DFW4 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Nop58Q6DFW4 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Nop58Q6DFW4 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Nop58Q6DFW4 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Nop58Q6DFW4 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Nop58Q6DFW4 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Nop58Q6DFW4 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Nop58Q6DFW4 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Nop58Q6DFW4 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Nop58Q6DFW4 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Nop58Q6DFW4 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Nop58Q6DFW4 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Nop58Q6DFW4 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Nop58Q6DFW4 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Nop58Q6DFW4 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Nop58Q6DFW4 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
Nop58Q6DFW4 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Nop58Q6DFW4 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Nop58Q6DFW4 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Nop58Q6DFW4 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Nop58Q6DFW4 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Nop58Q6DFW4 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Nop58Q6DFW4 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.4 ms