Protein–RNA interactions for Protein: Q6DFW0

Guanine nucleotide exchange C9orf72 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 481 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q6DFW0 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Q6DFW0 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Q6DFW0 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Q6DFW0 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Q6DFW0 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Q6DFW0 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Q6DFW0 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Q6DFW0 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Q6DFW0 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Q6DFW0 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Q6DFW0 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Q6DFW0 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Q6DFW0 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Q6DFW0 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Q6DFW0 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Q6DFW0 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Q6DFW0 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Q6DFW0 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Q6DFW0 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Q6DFW0 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Q6DFW0 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Q6DFW0 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Q6DFW0 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Q6DFW0 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Q6DFW0 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
Q6DFW0 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Q6DFW0 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Q6DFW0 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Q6DFW0 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Q6DFW0 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
Q6DFW0 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
Q6DFW0 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Q6DFW0 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Q6DFW0 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Q6DFW0 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Q6DFW0 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Q6DFW0 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Q6DFW0 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Q6DFW0 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Q6DFW0 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Q6DFW0 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Q6DFW0 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
Q6DFW0 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Q6DFW0 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Q6DFW0 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Q6DFW0 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Q6DFW0 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Q6DFW0 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Q6DFW0 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Q6DFW0 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Q6DFW0 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Q6DFW0 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Q6DFW0 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Q6DFW0 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Q6DFW0 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Q6DFW0 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Q6DFW0 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Q6DFW0 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Q6DFW0 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Q6DFW0 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Q6DFW0 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
Q6DFW0 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Q6DFW0 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Q6DFW0 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Q6DFW0 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Q6DFW0 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Q6DFW0 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Q6DFW0 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Q6DFW0 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Q6DFW0 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Q6DFW0 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Q6DFW0 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Q6DFW0 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Q6DFW0 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Q6DFW0 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Q6DFW0 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Q6DFW0 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Q6DFW0 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Q6DFW0 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Q6DFW0 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Q6DFW0 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Q6DFW0 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Q6DFW0 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Q6DFW0 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Q6DFW0 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Q6DFW0 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Q6DFW0 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Q6DFW0 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Q6DFW0 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Q6DFW0 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Q6DFW0 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
Q6DFW0 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
Q6DFW0 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Q6DFW0 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Q6DFW0 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Q6DFW0 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Q6DFW0 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Q6DFW0 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Q6DFW0 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Q6DFW0 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.9 ms