Protein–RNA interactions for Protein: Q69ZS6

Sv2c, Synaptic vesicle glycoprotein 2C, mousemouse

Predictions only

Length 727 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sv2cQ69ZS6 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Sv2cQ69ZS6 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Sv2cQ69ZS6 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
Sv2cQ69ZS6 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Sv2cQ69ZS6 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Sv2cQ69ZS6 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Sv2cQ69ZS6 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Sv2cQ69ZS6 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Sv2cQ69ZS6 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Sv2cQ69ZS6 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Sv2cQ69ZS6 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
Sv2cQ69ZS6 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Sv2cQ69ZS6 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Sv2cQ69ZS6 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Sv2cQ69ZS6 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Sv2cQ69ZS6 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Sv2cQ69ZS6 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Sv2cQ69ZS6 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Sv2cQ69ZS6 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Sv2cQ69ZS6 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Sv2cQ69ZS6 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Sv2cQ69ZS6 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Sv2cQ69ZS6 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Sv2cQ69ZS6 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Sv2cQ69ZS6 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Sv2cQ69ZS6 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
Sv2cQ69ZS6 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Sv2cQ69ZS6 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Sv2cQ69ZS6 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Sv2cQ69ZS6 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Sv2cQ69ZS6 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Sv2cQ69ZS6 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Sv2cQ69ZS6 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Sv2cQ69ZS6 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Sv2cQ69ZS6 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
Sv2cQ69ZS6 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Sv2cQ69ZS6 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Sv2cQ69ZS6 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Sv2cQ69ZS6 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
Sv2cQ69ZS6 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Sv2cQ69ZS6 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Sv2cQ69ZS6 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Sv2cQ69ZS6 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Sv2cQ69ZS6 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Sv2cQ69ZS6 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Sv2cQ69ZS6 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Sv2cQ69ZS6 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Sv2cQ69ZS6 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Sv2cQ69ZS6 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Sv2cQ69ZS6 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Sv2cQ69ZS6 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Sv2cQ69ZS6 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Sv2cQ69ZS6 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Sv2cQ69ZS6 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Sv2cQ69ZS6 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Sv2cQ69ZS6 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Sv2cQ69ZS6 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Sv2cQ69ZS6 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Sv2cQ69ZS6 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Sv2cQ69ZS6 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Sv2cQ69ZS6 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Sv2cQ69ZS6 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Sv2cQ69ZS6 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
Sv2cQ69ZS6 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Sv2cQ69ZS6 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Sv2cQ69ZS6 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Sv2cQ69ZS6 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Sv2cQ69ZS6 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Sv2cQ69ZS6 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Sv2cQ69ZS6 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Sv2cQ69ZS6 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Sv2cQ69ZS6 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Sv2cQ69ZS6 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Sv2cQ69ZS6 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Sv2cQ69ZS6 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
Sv2cQ69ZS6 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
Sv2cQ69ZS6 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Sv2cQ69ZS6 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
Sv2cQ69ZS6 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
Sv2cQ69ZS6 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Sv2cQ69ZS6 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
Sv2cQ69ZS6 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Sv2cQ69ZS6 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Sv2cQ69ZS6 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Sv2cQ69ZS6 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Sv2cQ69ZS6 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Sv2cQ69ZS6 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Sv2cQ69ZS6 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Sv2cQ69ZS6 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Sv2cQ69ZS6 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Sv2cQ69ZS6 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Sv2cQ69ZS6 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Sv2cQ69ZS6 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Sv2cQ69ZS6 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
Sv2cQ69ZS6 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Sv2cQ69ZS6 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Sv2cQ69ZS6 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Sv2cQ69ZS6 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Sv2cQ69ZS6 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Sv2cQ69ZS6 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.2 ms