Protein–RNA interactions for Protein: Q69Z98

Brsk2, Serine/threonine-protein kinase BRSK2, mousemouse

Predictions only

Length 735 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brsk2Q69Z98 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Brsk2Q69Z98 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Brsk2Q69Z98 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Brsk2Q69Z98 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Brsk2Q69Z98 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Brsk2Q69Z98 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Brsk2Q69Z98 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Brsk2Q69Z98 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Brsk2Q69Z98 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Brsk2Q69Z98 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Brsk2Q69Z98 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Brsk2Q69Z98 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Brsk2Q69Z98 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Brsk2Q69Z98 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Brsk2Q69Z98 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Brsk2Q69Z98 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Brsk2Q69Z98 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Brsk2Q69Z98 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Brsk2Q69Z98 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Brsk2Q69Z98 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Brsk2Q69Z98 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Brsk2Q69Z98 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Brsk2Q69Z98 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Brsk2Q69Z98 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Brsk2Q69Z98 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Brsk2Q69Z98 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Brsk2Q69Z98 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Brsk2Q69Z98 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Brsk2Q69Z98 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Brsk2Q69Z98 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Brsk2Q69Z98 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Brsk2Q69Z98 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Brsk2Q69Z98 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Brsk2Q69Z98 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Brsk2Q69Z98 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Brsk2Q69Z98 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Brsk2Q69Z98 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Brsk2Q69Z98 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Brsk2Q69Z98 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Brsk2Q69Z98 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Brsk2Q69Z98 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Brsk2Q69Z98 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Brsk2Q69Z98 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Brsk2Q69Z98 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Brsk2Q69Z98 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Brsk2Q69Z98 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Brsk2Q69Z98 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Brsk2Q69Z98 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Brsk2Q69Z98 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Brsk2Q69Z98 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Brsk2Q69Z98 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Brsk2Q69Z98 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Brsk2Q69Z98 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Brsk2Q69Z98 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Brsk2Q69Z98 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Brsk2Q69Z98 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Brsk2Q69Z98 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Brsk2Q69Z98 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Brsk2Q69Z98 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Brsk2Q69Z98 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Brsk2Q69Z98 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Brsk2Q69Z98 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Brsk2Q69Z98 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Brsk2Q69Z98 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Brsk2Q69Z98 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Brsk2Q69Z98 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Brsk2Q69Z98 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Brsk2Q69Z98 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Brsk2Q69Z98 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Brsk2Q69Z98 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Brsk2Q69Z98 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Brsk2Q69Z98 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Brsk2Q69Z98 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Brsk2Q69Z98 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Brsk2Q69Z98 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Brsk2Q69Z98 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Brsk2Q69Z98 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Brsk2Q69Z98 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Brsk2Q69Z98 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Brsk2Q69Z98 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Brsk2Q69Z98 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Brsk2Q69Z98 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Brsk2Q69Z98 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Brsk2Q69Z98 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Brsk2Q69Z98 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Brsk2Q69Z98 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Brsk2Q69Z98 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Brsk2Q69Z98 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Brsk2Q69Z98 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Brsk2Q69Z98 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Brsk2Q69Z98 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Brsk2Q69Z98 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Brsk2Q69Z98 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Brsk2Q69Z98 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Brsk2Q69Z98 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Brsk2Q69Z98 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Brsk2Q69Z98 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Brsk2Q69Z98 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Brsk2Q69Z98 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Brsk2Q69Z98 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.3 ms