Protein–RNA interactions for Protein: Q64705

Usf2, Upstream stimulatory factor 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 346 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usf2Q64705 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Usf2Q64705 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Usf2Q64705 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Usf2Q64705 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Usf2Q64705 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Usf2Q64705 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Usf2Q64705 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Usf2Q64705 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Usf2Q64705 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Usf2Q64705 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Usf2Q64705 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Usf2Q64705 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Usf2Q64705 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Usf2Q64705 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Usf2Q64705 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Usf2Q64705 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Usf2Q64705 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Usf2Q64705 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Usf2Q64705 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Usf2Q64705 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Usf2Q64705 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Usf2Q64705 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Usf2Q64705 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Usf2Q64705 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Usf2Q64705 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Usf2Q64705 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Usf2Q64705 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Usf2Q64705 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Usf2Q64705 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Usf2Q64705 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Usf2Q64705 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Usf2Q64705 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Usf2Q64705 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Usf2Q64705 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Usf2Q64705 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Usf2Q64705 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Usf2Q64705 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Usf2Q64705 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Usf2Q64705 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Usf2Q64705 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Usf2Q64705 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Usf2Q64705 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Usf2Q64705 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Usf2Q64705 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Usf2Q64705 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Usf2Q64705 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Usf2Q64705 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Usf2Q64705 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Usf2Q64705 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Usf2Q64705 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Usf2Q64705 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Usf2Q64705 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Usf2Q64705 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Usf2Q64705 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Usf2Q64705 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Usf2Q64705 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Usf2Q64705 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Usf2Q64705 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Usf2Q64705 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Usf2Q64705 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Usf2Q64705 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Usf2Q64705 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Usf2Q64705 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Usf2Q64705 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Usf2Q64705 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Usf2Q64705 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Usf2Q64705 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Usf2Q64705 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Usf2Q64705 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Usf2Q64705 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Usf2Q64705 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Usf2Q64705 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Usf2Q64705 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Usf2Q64705 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Usf2Q64705 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Usf2Q64705 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Usf2Q64705 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Usf2Q64705 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Usf2Q64705 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Usf2Q64705 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Usf2Q64705 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Usf2Q64705 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Usf2Q64705 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Usf2Q64705 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Usf2Q64705 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Usf2Q64705 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Usf2Q64705 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Usf2Q64705 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Usf2Q64705 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Usf2Q64705 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Usf2Q64705 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Usf2Q64705 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Usf2Q64705 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Usf2Q64705 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Usf2Q64705 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Usf2Q64705 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Usf2Q64705 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Usf2Q64705 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Usf2Q64705 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Usf2Q64705 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.3 ms