Protein–RNA interactions for Protein: Q640N4

Zfp248, Zinc finger protein 248, mousemouse

Predictions only

Length 576 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfp248Q640N4 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC14□□□□□ -0.17
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Zfp248Q640N4 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
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Zfp248Q640N4 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
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Zfp248Q640N4 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
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Zfp248Q640N4 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Zfp248Q640N4 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Zfp248Q640N4 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Zfp248Q640N4 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Zfp248Q640N4 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
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Zfp248Q640N4 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Zfp248Q640N4 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Zfp248Q640N4 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Zfp248Q640N4 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Zfp248Q640N4 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC13.96□□□□□ -0.18
Zfp248Q640N4 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Zfp248Q640N4 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Zfp248Q640N4 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Zfp248Q640N4 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Zfp248Q640N4 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Zfp248Q640N4 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Zfp248Q640N4 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Zfp248Q640N4 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
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