Protein–RNA interactions for Protein: Q62521

Zic3, Zinc finger protein ZIC 3, mousemouse

Predictions only

Length 466 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zic3Q62521 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Zic3Q62521 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Zic3Q62521 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Zic3Q62521 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Zic3Q62521 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Zic3Q62521 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Zic3Q62521 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Zic3Q62521 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Zic3Q62521 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Zic3Q62521 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Zic3Q62521 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Zic3Q62521 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Zic3Q62521 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Zic3Q62521 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Zic3Q62521 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Zic3Q62521 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Zic3Q62521 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Zic3Q62521 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Zic3Q62521 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Zic3Q62521 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Zic3Q62521 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Zic3Q62521 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Zic3Q62521 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Zic3Q62521 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Zic3Q62521 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Zic3Q62521 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Zic3Q62521 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Zic3Q62521 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Zic3Q62521 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Zic3Q62521 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Zic3Q62521 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Zic3Q62521 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Zic3Q62521 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Zic3Q62521 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Zic3Q62521 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Zic3Q62521 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Zic3Q62521 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Zic3Q62521 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Zic3Q62521 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Zic3Q62521 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Zic3Q62521 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Zic3Q62521 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Zic3Q62521 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Zic3Q62521 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Zic3Q62521 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Zic3Q62521 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Zic3Q62521 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Zic3Q62521 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Zic3Q62521 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Zic3Q62521 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Zic3Q62521 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Zic3Q62521 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Zic3Q62521 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Zic3Q62521 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Zic3Q62521 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Zic3Q62521 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Zic3Q62521 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Zic3Q62521 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Zic3Q62521 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Zic3Q62521 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Zic3Q62521 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Zic3Q62521 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Zic3Q62521 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Zic3Q62521 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Zic3Q62521 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Zic3Q62521 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Zic3Q62521 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Zic3Q62521 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Zic3Q62521 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Zic3Q62521 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Zic3Q62521 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Zic3Q62521 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Zic3Q62521 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Zic3Q62521 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Zic3Q62521 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Zic3Q62521 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Zic3Q62521 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Zic3Q62521 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Zic3Q62521 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Zic3Q62521 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Zic3Q62521 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Zic3Q62521 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Zic3Q62521 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Zic3Q62521 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Zic3Q62521 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Zic3Q62521 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Zic3Q62521 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Zic3Q62521 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Zic3Q62521 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Zic3Q62521 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Zic3Q62521 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Zic3Q62521 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Zic3Q62521 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Zic3Q62521 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Zic3Q62521 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Zic3Q62521 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Zic3Q62521 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Zic3Q62521 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Zic3Q62521 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Zic3Q62521 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.9 ms