Protein–RNA interactions for Protein: Q62470

Itga3, Integrin alpha-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,053 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itga3Q62470 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Itga3Q62470 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Itga3Q62470 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Itga3Q62470 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
Itga3Q62470 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Itga3Q62470 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Itga3Q62470 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Itga3Q62470 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Itga3Q62470 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Itga3Q62470 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Itga3Q62470 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Itga3Q62470 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Itga3Q62470 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Itga3Q62470 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Itga3Q62470 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Itga3Q62470 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Itga3Q62470 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Itga3Q62470 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Itga3Q62470 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Itga3Q62470 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Itga3Q62470 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Itga3Q62470 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
Itga3Q62470 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Itga3Q62470 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Itga3Q62470 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Itga3Q62470 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Itga3Q62470 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Itga3Q62470 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Itga3Q62470 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Itga3Q62470 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Itga3Q62470 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Itga3Q62470 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Itga3Q62470 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Itga3Q62470 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Itga3Q62470 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Itga3Q62470 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
Itga3Q62470 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
Itga3Q62470 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC18.83■□□□□ 0.61
Itga3Q62470 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Itga3Q62470 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC18.83■□□□□ 0.61
Itga3Q62470 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Itga3Q62470 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Itga3Q62470 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Itga3Q62470 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Itga3Q62470 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Itga3Q62470 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Itga3Q62470 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Itga3Q62470 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Itga3Q62470 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Itga3Q62470 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Itga3Q62470 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Itga3Q62470 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Itga3Q62470 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Itga3Q62470 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Itga3Q62470 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Itga3Q62470 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Itga3Q62470 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Itga3Q62470 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Itga3Q62470 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Itga3Q62470 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Itga3Q62470 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Itga3Q62470 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Itga3Q62470 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Itga3Q62470 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Itga3Q62470 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Itga3Q62470 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
Itga3Q62470 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Itga3Q62470 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Itga3Q62470 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Itga3Q62470 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Itga3Q62470 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Itga3Q62470 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Itga3Q62470 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Itga3Q62470 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
Itga3Q62470 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Itga3Q62470 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Itga3Q62470 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Itga3Q62470 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Itga3Q62470 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Itga3Q62470 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Itga3Q62470 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Itga3Q62470 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
Itga3Q62470 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Itga3Q62470 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Itga3Q62470 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Itga3Q62470 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Itga3Q62470 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Itga3Q62470 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Itga3Q62470 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Itga3Q62470 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Itga3Q62470 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Itga3Q62470 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Itga3Q62470 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Itga3Q62470 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Itga3Q62470 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Itga3Q62470 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Itga3Q62470 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Itga3Q62470 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
Itga3Q62470 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Itga3Q62470 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.6 ms