Protein–RNA interactions for Protein: Q62458

Gm20809, (clone BALB14N), mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20809Q62458 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
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Gm20809Q62458 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm20809Q62458 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
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Gm20809Q62458 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
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Gm20809Q62458 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
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Gm20809Q62458 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
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Gm20809Q62458 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
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Gm20809Q62458 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm20809Q62458 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm20809Q62458 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm20809Q62458 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm20809Q62458 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
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Gm20809Q62458 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm20809Q62458 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
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Gm20809Q62458 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
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Gm20809Q62458 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm20809Q62458 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm20809Q62458 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm20809Q62458 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm20809Q62458 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm20809Q62458 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm20809Q62458 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm20809Q62458 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm20809Q62458 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm20809Q62458 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm20809Q62458 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm20809Q62458 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm20809Q62458 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm20809Q62458 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm20809Q62458 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm20809Q62458 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm20809Q62458 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm20809Q62458 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm20809Q62458 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm20809Q62458 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm20809Q62458 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm20809Q62458 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
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