Protein–RNA interactions for Protein: Q62442

Vamp1, Vesicle-associated membrane protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 118 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vamp1Q62442 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vamp1Q62442 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vamp1Q62442 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vamp1Q62442 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vamp1Q62442 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vamp1Q62442 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Vamp1Q62442 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vamp1Q62442 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vamp1Q62442 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vamp1Q62442 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vamp1Q62442 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vamp1Q62442 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Vamp1Q62442 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vamp1Q62442 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vamp1Q62442 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vamp1Q62442 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vamp1Q62442 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vamp1Q62442 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vamp1Q62442 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vamp1Q62442 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vamp1Q62442 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vamp1Q62442 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Vamp1Q62442 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vamp1Q62442 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vamp1Q62442 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vamp1Q62442 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vamp1Q62442 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vamp1Q62442 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vamp1Q62442 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vamp1Q62442 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vamp1Q62442 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vamp1Q62442 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vamp1Q62442 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Vamp1Q62442 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vamp1Q62442 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vamp1Q62442 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vamp1Q62442 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vamp1Q62442 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vamp1Q62442 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vamp1Q62442 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vamp1Q62442 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Vamp1Q62442 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vamp1Q62442 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vamp1Q62442 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vamp1Q62442 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vamp1Q62442 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vamp1Q62442 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vamp1Q62442 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vamp1Q62442 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vamp1Q62442 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Vamp1Q62442 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vamp1Q62442 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vamp1Q62442 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Vamp1Q62442 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Vamp1Q62442 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Vamp1Q62442 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Vamp1Q62442 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Vamp1Q62442 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Vamp1Q62442 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Vamp1Q62442 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Vamp1Q62442 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Vamp1Q62442 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Vamp1Q62442 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Vamp1Q62442 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Vamp1Q62442 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Vamp1Q62442 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Vamp1Q62442 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Vamp1Q62442 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Vamp1Q62442 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Vamp1Q62442 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Vamp1Q62442 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Vamp1Q62442 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Vamp1Q62442 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Vamp1Q62442 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Vamp1Q62442 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Vamp1Q62442 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Vamp1Q62442 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Vamp1Q62442 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Vamp1Q62442 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Vamp1Q62442 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Vamp1Q62442 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Vamp1Q62442 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Vamp1Q62442 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Vamp1Q62442 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Vamp1Q62442 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Vamp1Q62442 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Vamp1Q62442 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Vamp1Q62442 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Vamp1Q62442 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Vamp1Q62442 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Vamp1Q62442 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Vamp1Q62442 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Vamp1Q62442 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Vamp1Q62442 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Vamp1Q62442 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Vamp1Q62442 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Vamp1Q62442 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Vamp1Q62442 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Vamp1Q62442 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Vamp1Q62442 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.3 ms