Protein–RNA interactions for Protein: Q62313

Tgoln1, Trans-Golgi network integral membrane protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 353 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tgoln1Q62313 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tgoln1Q62313 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tgoln1Q62313 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Tgoln1Q62313 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Tgoln1Q62313 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tgoln1Q62313 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tgoln1Q62313 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tgoln1Q62313 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tgoln1Q62313 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tgoln1Q62313 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tgoln1Q62313 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tgoln1Q62313 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tgoln1Q62313 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tgoln1Q62313 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tgoln1Q62313 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tgoln1Q62313 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Tgoln1Q62313 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tgoln1Q62313 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tgoln1Q62313 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tgoln1Q62313 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tgoln1Q62313 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tgoln1Q62313 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tgoln1Q62313 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tgoln1Q62313 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tgoln1Q62313 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Tgoln1Q62313 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tgoln1Q62313 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tgoln1Q62313 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Tgoln1Q62313 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tgoln1Q62313 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tgoln1Q62313 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tgoln1Q62313 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tgoln1Q62313 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tgoln1Q62313 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tgoln1Q62313 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tgoln1Q62313 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tgoln1Q62313 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tgoln1Q62313 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tgoln1Q62313 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tgoln1Q62313 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tgoln1Q62313 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tgoln1Q62313 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tgoln1Q62313 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tgoln1Q62313 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Tgoln1Q62313 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tgoln1Q62313 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tgoln1Q62313 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tgoln1Q62313 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tgoln1Q62313 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tgoln1Q62313 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tgoln1Q62313 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Tgoln1Q62313 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
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Tgoln1Q62313 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Tgoln1Q62313 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tgoln1Q62313 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tgoln1Q62313 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tgoln1Q62313 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tgoln1Q62313 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
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Tgoln1Q62313 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
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Tgoln1Q62313 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tgoln1Q62313 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tgoln1Q62313 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tgoln1Q62313 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tgoln1Q62313 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tgoln1Q62313 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tgoln1Q62313 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tgoln1Q62313 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tgoln1Q62313 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tgoln1Q62313 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tgoln1Q62313 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tgoln1Q62313 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tgoln1Q62313 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tgoln1Q62313 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tgoln1Q62313 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tgoln1Q62313 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tgoln1Q62313 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tgoln1Q62313 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Tgoln1Q62313 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tgoln1Q62313 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tgoln1Q62313 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tgoln1Q62313 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tgoln1Q62313 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tgoln1Q62313 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tgoln1Q62313 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tgoln1Q62313 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tgoln1Q62313 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tgoln1Q62313 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tgoln1Q62313 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tgoln1Q62313 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tgoln1Q62313 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Tgoln1Q62313 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tgoln1Q62313 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tgoln1Q62313 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tgoln1Q62313 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tgoln1Q62313 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.6 ms