Protein–RNA interactions for Protein: Q62311

Taf6, Transcription initiation factor TFIID subunit 6, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 678 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Taf6Q62311 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Taf6Q62311 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Taf6Q62311 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Taf6Q62311 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Taf6Q62311 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Taf6Q62311 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Taf6Q62311 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Taf6Q62311 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Taf6Q62311 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Taf6Q62311 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Taf6Q62311 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Taf6Q62311 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Taf6Q62311 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Taf6Q62311 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Taf6Q62311 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Taf6Q62311 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Taf6Q62311 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Taf6Q62311 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Taf6Q62311 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Taf6Q62311 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Taf6Q62311 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Taf6Q62311 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Taf6Q62311 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Taf6Q62311 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Taf6Q62311 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Taf6Q62311 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Taf6Q62311 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Taf6Q62311 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Taf6Q62311 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Taf6Q62311 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Taf6Q62311 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Taf6Q62311 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Taf6Q62311 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Taf6Q62311 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Taf6Q62311 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Taf6Q62311 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Taf6Q62311 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Taf6Q62311 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Taf6Q62311 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Taf6Q62311 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Taf6Q62311 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Taf6Q62311 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Taf6Q62311 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Taf6Q62311 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Taf6Q62311 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Taf6Q62311 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Taf6Q62311 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Taf6Q62311 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Taf6Q62311 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Taf6Q62311 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Taf6Q62311 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Taf6Q62311 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Taf6Q62311 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Taf6Q62311 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Taf6Q62311 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Taf6Q62311 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Taf6Q62311 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Taf6Q62311 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Taf6Q62311 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Taf6Q62311 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Taf6Q62311 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Taf6Q62311 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Taf6Q62311 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Taf6Q62311 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Taf6Q62311 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Taf6Q62311 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Taf6Q62311 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Taf6Q62311 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Taf6Q62311 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Taf6Q62311 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Taf6Q62311 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Taf6Q62311 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Taf6Q62311 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Taf6Q62311 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Taf6Q62311 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Taf6Q62311 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Taf6Q62311 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Taf6Q62311 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Taf6Q62311 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Taf6Q62311 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Taf6Q62311 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Taf6Q62311 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Taf6Q62311 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Taf6Q62311 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Taf6Q62311 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Taf6Q62311 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Taf6Q62311 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Taf6Q62311 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Taf6Q62311 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Taf6Q62311 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Taf6Q62311 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Taf6Q62311 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Taf6Q62311 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Taf6Q62311 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Taf6Q62311 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Taf6Q62311 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Taf6Q62311 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Taf6Q62311 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Taf6Q62311 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Taf6Q62311 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.4 ms