Protein–RNA interactions for Protein: Q61738

Itga7, Integrin alpha-7, mousemouse

Predictions only

Length 1,179 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itga7Q61738 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Itga7Q61738 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Itga7Q61738 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Itga7Q61738 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Itga7Q61738 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Itga7Q61738 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Itga7Q61738 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Itga7Q61738 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Itga7Q61738 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Itga7Q61738 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Itga7Q61738 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Itga7Q61738 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Itga7Q61738 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Itga7Q61738 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Itga7Q61738 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Itga7Q61738 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Itga7Q61738 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Itga7Q61738 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Itga7Q61738 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Itga7Q61738 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Itga7Q61738 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Itga7Q61738 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Itga7Q61738 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Itga7Q61738 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Itga7Q61738 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Itga7Q61738 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Itga7Q61738 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Itga7Q61738 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Itga7Q61738 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Itga7Q61738 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Itga7Q61738 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Itga7Q61738 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Itga7Q61738 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Itga7Q61738 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Itga7Q61738 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Itga7Q61738 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Itga7Q61738 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Itga7Q61738 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Itga7Q61738 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Itga7Q61738 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Itga7Q61738 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Itga7Q61738 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Itga7Q61738 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Itga7Q61738 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Itga7Q61738 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Itga7Q61738 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Itga7Q61738 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Itga7Q61738 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Itga7Q61738 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Itga7Q61738 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Itga7Q61738 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Itga7Q61738 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Itga7Q61738 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Itga7Q61738 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Itga7Q61738 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Itga7Q61738 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Itga7Q61738 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Itga7Q61738 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Itga7Q61738 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Itga7Q61738 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Itga7Q61738 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Itga7Q61738 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Itga7Q61738 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Itga7Q61738 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Itga7Q61738 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Itga7Q61738 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Itga7Q61738 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Itga7Q61738 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Itga7Q61738 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Itga7Q61738 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Itga7Q61738 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Itga7Q61738 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Itga7Q61738 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Itga7Q61738 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Itga7Q61738 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Itga7Q61738 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Itga7Q61738 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Itga7Q61738 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Itga7Q61738 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Itga7Q61738 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Itga7Q61738 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Itga7Q61738 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Itga7Q61738 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Itga7Q61738 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Itga7Q61738 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Itga7Q61738 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Itga7Q61738 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Itga7Q61738 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Itga7Q61738 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Itga7Q61738 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Itga7Q61738 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Itga7Q61738 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Itga7Q61738 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Itga7Q61738 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Itga7Q61738 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Itga7Q61738 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Itga7Q61738 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Itga7Q61738 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Itga7Q61738 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Itga7Q61738 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.2 ms