Protein–RNA interactions for Protein: Q61412

Vsx2, Visual system homeobox 2, mousemouse

Predictions only

Length 361 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vsx2Q61412 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Vsx2Q61412 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Vsx2Q61412 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Vsx2Q61412 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Vsx2Q61412 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Vsx2Q61412 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Vsx2Q61412 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Vsx2Q61412 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Vsx2Q61412 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Vsx2Q61412 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Vsx2Q61412 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Vsx2Q61412 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Vsx2Q61412 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Vsx2Q61412 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Vsx2Q61412 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Vsx2Q61412 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Vsx2Q61412 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Vsx2Q61412 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Vsx2Q61412 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Vsx2Q61412 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Vsx2Q61412 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Vsx2Q61412 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Vsx2Q61412 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Vsx2Q61412 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Vsx2Q61412 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Vsx2Q61412 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Vsx2Q61412 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Vsx2Q61412 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Vsx2Q61412 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Vsx2Q61412 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Vsx2Q61412 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Vsx2Q61412 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Vsx2Q61412 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Vsx2Q61412 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Vsx2Q61412 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Vsx2Q61412 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Vsx2Q61412 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Vsx2Q61412 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Vsx2Q61412 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Vsx2Q61412 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Vsx2Q61412 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Vsx2Q61412 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Vsx2Q61412 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Vsx2Q61412 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Vsx2Q61412 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Vsx2Q61412 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Vsx2Q61412 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Vsx2Q61412 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Vsx2Q61412 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Vsx2Q61412 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Vsx2Q61412 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Vsx2Q61412 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Vsx2Q61412 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Vsx2Q61412 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Vsx2Q61412 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Vsx2Q61412 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Vsx2Q61412 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Vsx2Q61412 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Vsx2Q61412 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Vsx2Q61412 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Vsx2Q61412 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Vsx2Q61412 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Vsx2Q61412 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Vsx2Q61412 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Vsx2Q61412 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Vsx2Q61412 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Vsx2Q61412 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Vsx2Q61412 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Vsx2Q61412 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Vsx2Q61412 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Vsx2Q61412 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Vsx2Q61412 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Vsx2Q61412 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Vsx2Q61412 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Vsx2Q61412 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Vsx2Q61412 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Vsx2Q61412 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Vsx2Q61412 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Vsx2Q61412 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Vsx2Q61412 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Vsx2Q61412 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Vsx2Q61412 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Vsx2Q61412 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Vsx2Q61412 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Vsx2Q61412 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Vsx2Q61412 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Vsx2Q61412 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Vsx2Q61412 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Vsx2Q61412 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Vsx2Q61412 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Vsx2Q61412 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Vsx2Q61412 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Vsx2Q61412 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Vsx2Q61412 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Vsx2Q61412 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Vsx2Q61412 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Vsx2Q61412 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Vsx2Q61412 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Vsx2Q61412 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Vsx2Q61412 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.2 ms