Protein–RNA interactions for Protein: Q61398

Pcolce, Procollagen C-endopeptidase enhancer 1, mousemouse

Predictions only

Length 468 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PcolceQ61398 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PcolceQ61398 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PcolceQ61398 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PcolceQ61398 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PcolceQ61398 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PcolceQ61398 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PcolceQ61398 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PcolceQ61398 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PcolceQ61398 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PcolceQ61398 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PcolceQ61398 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PcolceQ61398 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PcolceQ61398 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
PcolceQ61398 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
PcolceQ61398 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
PcolceQ61398 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
PcolceQ61398 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
PcolceQ61398 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
PcolceQ61398 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PcolceQ61398 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PcolceQ61398 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
PcolceQ61398 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
PcolceQ61398 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PcolceQ61398 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PcolceQ61398 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PcolceQ61398 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PcolceQ61398 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PcolceQ61398 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PcolceQ61398 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PcolceQ61398 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PcolceQ61398 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PcolceQ61398 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PcolceQ61398 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PcolceQ61398 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
PcolceQ61398 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PcolceQ61398 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PcolceQ61398 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PcolceQ61398 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PcolceQ61398 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
PcolceQ61398 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PcolceQ61398 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PcolceQ61398 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PcolceQ61398 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PcolceQ61398 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PcolceQ61398 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PcolceQ61398 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PcolceQ61398 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PcolceQ61398 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PcolceQ61398 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PcolceQ61398 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PcolceQ61398 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PcolceQ61398 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PcolceQ61398 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PcolceQ61398 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PcolceQ61398 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PcolceQ61398 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PcolceQ61398 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PcolceQ61398 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PcolceQ61398 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PcolceQ61398 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
PcolceQ61398 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
PcolceQ61398 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
PcolceQ61398 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PcolceQ61398 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PcolceQ61398 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PcolceQ61398 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PcolceQ61398 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PcolceQ61398 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PcolceQ61398 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PcolceQ61398 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PcolceQ61398 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PcolceQ61398 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PcolceQ61398 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PcolceQ61398 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PcolceQ61398 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PcolceQ61398 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PcolceQ61398 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PcolceQ61398 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PcolceQ61398 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PcolceQ61398 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PcolceQ61398 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PcolceQ61398 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PcolceQ61398 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PcolceQ61398 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PcolceQ61398 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
PcolceQ61398 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PcolceQ61398 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PcolceQ61398 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PcolceQ61398 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PcolceQ61398 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PcolceQ61398 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PcolceQ61398 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PcolceQ61398 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PcolceQ61398 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PcolceQ61398 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PcolceQ61398 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PcolceQ61398 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PcolceQ61398 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PcolceQ61398 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PcolceQ61398 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.8 ms