Protein–RNA interactions for Protein: Q61286

Tcf12, Transcription factor 12, mousemouse

Predictions only

Length 706 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tcf12Q61286 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Tcf12Q61286 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Tcf12Q61286 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Tcf12Q61286 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Tcf12Q61286 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Tcf12Q61286 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Tcf12Q61286 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Tcf12Q61286 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Tcf12Q61286 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
Tcf12Q61286 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Tcf12Q61286 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Tcf12Q61286 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Tcf12Q61286 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Tcf12Q61286 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Tcf12Q61286 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Tcf12Q61286 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Tcf12Q61286 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Tcf12Q61286 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
Tcf12Q61286 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Tcf12Q61286 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Tcf12Q61286 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Tcf12Q61286 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Tcf12Q61286 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Tcf12Q61286 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
Tcf12Q61286 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
Tcf12Q61286 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
Tcf12Q61286 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
Tcf12Q61286 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Tcf12Q61286 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Tcf12Q61286 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC20■□□□□ 0.79
Tcf12Q61286 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Tcf12Q61286 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Tcf12Q61286 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Tcf12Q61286 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Tcf12Q61286 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Tcf12Q61286 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Tcf12Q61286 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Tcf12Q61286 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Tcf12Q61286 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Tcf12Q61286 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Tcf12Q61286 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Tcf12Q61286 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Tcf12Q61286 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Tcf12Q61286 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Tcf12Q61286 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Tcf12Q61286 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Tcf12Q61286 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Tcf12Q61286 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Tcf12Q61286 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Tcf12Q61286 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Tcf12Q61286 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Tcf12Q61286 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Tcf12Q61286 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Tcf12Q61286 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Tcf12Q61286 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
Tcf12Q61286 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Tcf12Q61286 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Tcf12Q61286 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Tcf12Q61286 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Tcf12Q61286 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Tcf12Q61286 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Tcf12Q61286 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Tcf12Q61286 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
Tcf12Q61286 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Tcf12Q61286 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Tcf12Q61286 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Tcf12Q61286 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Tcf12Q61286 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Tcf12Q61286 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Tcf12Q61286 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Tcf12Q61286 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Tcf12Q61286 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Tcf12Q61286 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Tcf12Q61286 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Tcf12Q61286 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Tcf12Q61286 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Tcf12Q61286 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Tcf12Q61286 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Tcf12Q61286 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Tcf12Q61286 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Tcf12Q61286 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
Tcf12Q61286 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
Tcf12Q61286 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Tcf12Q61286 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Tcf12Q61286 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Tcf12Q61286 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Tcf12Q61286 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.79
Tcf12Q61286 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Tcf12Q61286 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
Tcf12Q61286 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Tcf12Q61286 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Tcf12Q61286 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Tcf12Q61286 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Tcf12Q61286 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Tcf12Q61286 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Tcf12Q61286 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
Tcf12Q61286 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Tcf12Q61286 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Tcf12Q61286 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Tcf12Q61286 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.8 ms