Protein–RNA interactions for Protein: Q61001

Lama5, Laminin subunit alpha-5, mousemouse

Predictions only

Length 3,718 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lama5Q61001 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
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Lama5Q61001 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lama5Q61001 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lama5Q61001 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lama5Q61001 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lama5Q61001 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lama5Q61001 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lama5Q61001 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lama5Q61001 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lama5Q61001 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lama5Q61001 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lama5Q61001 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lama5Q61001 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lama5Q61001 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lama5Q61001 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lama5Q61001 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lama5Q61001 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lama5Q61001 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Lama5Q61001 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lama5Q61001 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lama5Q61001 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lama5Q61001 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lama5Q61001 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lama5Q61001 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Lama5Q61001 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Lama5Q61001 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Lama5Q61001 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Lama5Q61001 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lama5Q61001 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lama5Q61001 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lama5Q61001 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lama5Q61001 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lama5Q61001 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lama5Q61001 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lama5Q61001 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lama5Q61001 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lama5Q61001 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lama5Q61001 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
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Lama5Q61001 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lama5Q61001 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
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Lama5Q61001 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lama5Q61001 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lama5Q61001 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lama5Q61001 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lama5Q61001 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lama5Q61001 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lama5Q61001 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Lama5Q61001 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lama5Q61001 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lama5Q61001 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lama5Q61001 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lama5Q61001 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Lama5Q61001 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lama5Q61001 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lama5Q61001 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lama5Q61001 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lama5Q61001 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lama5Q61001 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lama5Q61001 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lama5Q61001 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
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Lama5Q61001 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lama5Q61001 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
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Lama5Q61001 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lama5Q61001 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
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Lama5Q61001 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
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Lama5Q61001 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
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Lama5Q61001 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lama5Q61001 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lama5Q61001 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lama5Q61001 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lama5Q61001 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Lama5Q61001 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lama5Q61001 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lama5Q61001 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lama5Q61001 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lama5Q61001 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lama5Q61001 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lama5Q61001 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lama5Q61001 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lama5Q61001 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lama5Q61001 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Lama5Q61001 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Lama5Q61001 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Lama5Q61001 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Lama5Q61001 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Lama5Q61001 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Lama5Q61001 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Lama5Q61001 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Lama5Q61001 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Lama5Q61001 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Lama5Q61001 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
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