Protein–RNA interactions for Protein: Q60987

Foxg1, Forkhead box protein G1, mousemouse

Predictions only

Length 481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Foxg1Q60987 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Foxg1Q60987 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Foxg1Q60987 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Foxg1Q60987 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Foxg1Q60987 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Foxg1Q60987 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Foxg1Q60987 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Foxg1Q60987 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Foxg1Q60987 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Foxg1Q60987 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Foxg1Q60987 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Foxg1Q60987 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Foxg1Q60987 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Foxg1Q60987 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Foxg1Q60987 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Foxg1Q60987 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Foxg1Q60987 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Foxg1Q60987 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Foxg1Q60987 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Foxg1Q60987 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Foxg1Q60987 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Foxg1Q60987 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Foxg1Q60987 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Foxg1Q60987 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Foxg1Q60987 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Foxg1Q60987 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Foxg1Q60987 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Foxg1Q60987 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Foxg1Q60987 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Foxg1Q60987 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Foxg1Q60987 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Foxg1Q60987 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Foxg1Q60987 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Foxg1Q60987 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Foxg1Q60987 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Foxg1Q60987 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Foxg1Q60987 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Foxg1Q60987 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Foxg1Q60987 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Foxg1Q60987 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Foxg1Q60987 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Foxg1Q60987 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Foxg1Q60987 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Foxg1Q60987 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Foxg1Q60987 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Foxg1Q60987 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Foxg1Q60987 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Foxg1Q60987 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Foxg1Q60987 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Foxg1Q60987 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Foxg1Q60987 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Foxg1Q60987 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Foxg1Q60987 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Foxg1Q60987 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Foxg1Q60987 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Foxg1Q60987 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Foxg1Q60987 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Foxg1Q60987 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Foxg1Q60987 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Foxg1Q60987 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Foxg1Q60987 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Foxg1Q60987 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Foxg1Q60987 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Foxg1Q60987 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Foxg1Q60987 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Foxg1Q60987 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Foxg1Q60987 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Foxg1Q60987 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Foxg1Q60987 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Foxg1Q60987 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Foxg1Q60987 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Foxg1Q60987 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Foxg1Q60987 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Foxg1Q60987 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Foxg1Q60987 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Foxg1Q60987 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Foxg1Q60987 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Foxg1Q60987 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Foxg1Q60987 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Foxg1Q60987 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Foxg1Q60987 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Foxg1Q60987 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Foxg1Q60987 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Foxg1Q60987 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Foxg1Q60987 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Foxg1Q60987 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Foxg1Q60987 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Foxg1Q60987 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Foxg1Q60987 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Foxg1Q60987 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Foxg1Q60987 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Foxg1Q60987 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Foxg1Q60987 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Foxg1Q60987 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Foxg1Q60987 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Foxg1Q60987 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Foxg1Q60987 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Foxg1Q60987 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Foxg1Q60987 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Foxg1Q60987 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.1 ms