Protein–RNA interactions for Protein: Q60764

Mkrn3, Probable E3 ubiquitin-protein ligase makorin-3, mousemouse

Predictions only

Length 544 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mkrn3Q60764 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Mkrn3Q60764 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Mkrn3Q60764 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Mkrn3Q60764 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
Mkrn3Q60764 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Mkrn3Q60764 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Mkrn3Q60764 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Mkrn3Q60764 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC20.52■□□□□ 0.87
Mkrn3Q60764 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Mkrn3Q60764 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Mkrn3Q60764 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Mkrn3Q60764 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Mkrn3Q60764 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Mkrn3Q60764 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Mkrn3Q60764 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Mkrn3Q60764 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Mkrn3Q60764 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Mkrn3Q60764 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Mkrn3Q60764 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Mkrn3Q60764 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Mkrn3Q60764 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Mkrn3Q60764 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Mkrn3Q60764 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Mkrn3Q60764 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Mkrn3Q60764 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Mkrn3Q60764 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Mkrn3Q60764 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Mkrn3Q60764 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Mkrn3Q60764 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Mkrn3Q60764 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Mkrn3Q60764 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Mkrn3Q60764 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Mkrn3Q60764 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Mkrn3Q60764 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Mkrn3Q60764 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Mkrn3Q60764 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Mkrn3Q60764 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Mkrn3Q60764 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Mkrn3Q60764 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Mkrn3Q60764 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Mkrn3Q60764 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Mkrn3Q60764 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Mkrn3Q60764 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Mkrn3Q60764 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Mkrn3Q60764 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Mkrn3Q60764 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Mkrn3Q60764 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Mkrn3Q60764 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Mkrn3Q60764 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Mkrn3Q60764 AC073947.1-201ENSMUST00000216991 649 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Mkrn3Q60764 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Mkrn3Q60764 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Mkrn3Q60764 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Mkrn3Q60764 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Mkrn3Q60764 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Mkrn3Q60764 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Mkrn3Q60764 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Mkrn3Q60764 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Mkrn3Q60764 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Mkrn3Q60764 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Mkrn3Q60764 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Mkrn3Q60764 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Mkrn3Q60764 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Mkrn3Q60764 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Mkrn3Q60764 Gm19891-201ENSMUST00000189771 303 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Mkrn3Q60764 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Mkrn3Q60764 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Mkrn3Q60764 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Mkrn3Q60764 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Mkrn3Q60764 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Mkrn3Q60764 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Mkrn3Q60764 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Mkrn3Q60764 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Mkrn3Q60764 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Mkrn3Q60764 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Mkrn3Q60764 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Mkrn3Q60764 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Mkrn3Q60764 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Mkrn3Q60764 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Mkrn3Q60764 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Mkrn3Q60764 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Mkrn3Q60764 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Mkrn3Q60764 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Mkrn3Q60764 Zfp1-201ENSMUST00000077791 1811 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Mkrn3Q60764 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Mkrn3Q60764 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Mkrn3Q60764 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Mkrn3Q60764 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Mkrn3Q60764 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Mkrn3Q60764 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Mkrn3Q60764 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Mkrn3Q60764 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Mkrn3Q60764 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Mkrn3Q60764 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Mkrn3Q60764 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Mkrn3Q60764 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Mkrn3Q60764 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Mkrn3Q60764 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Mkrn3Q60764 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Mkrn3Q60764 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.8 ms