Protein–RNA interactions for Protein: Q60670

Sik1, Serine/threonine-protein kinase SIK1, mousemouse

Predictions only

Length 779 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sik1Q60670 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Sik1Q60670 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Sik1Q60670 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Sik1Q60670 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Sik1Q60670 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Sik1Q60670 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Sik1Q60670 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Sik1Q60670 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Sik1Q60670 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Sik1Q60670 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Sik1Q60670 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Sik1Q60670 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Sik1Q60670 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
Sik1Q60670 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Sik1Q60670 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
Sik1Q60670 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Sik1Q60670 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Sik1Q60670 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Sik1Q60670 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Sik1Q60670 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Sik1Q60670 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Sik1Q60670 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Sik1Q60670 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Sik1Q60670 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Sik1Q60670 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Sik1Q60670 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Sik1Q60670 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Sik1Q60670 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Sik1Q60670 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Sik1Q60670 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Sik1Q60670 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Sik1Q60670 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Sik1Q60670 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Sik1Q60670 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Sik1Q60670 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Sik1Q60670 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Sik1Q60670 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Sik1Q60670 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Sik1Q60670 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Sik1Q60670 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Sik1Q60670 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Sik1Q60670 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Sik1Q60670 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Sik1Q60670 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Sik1Q60670 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Sik1Q60670 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Sik1Q60670 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Sik1Q60670 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Sik1Q60670 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Sik1Q60670 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Sik1Q60670 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Sik1Q60670 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Sik1Q60670 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Sik1Q60670 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Sik1Q60670 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Sik1Q60670 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Sik1Q60670 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Sik1Q60670 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Sik1Q60670 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Sik1Q60670 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Sik1Q60670 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Sik1Q60670 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Sik1Q60670 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Sik1Q60670 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Sik1Q60670 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Sik1Q60670 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Sik1Q60670 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Sik1Q60670 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Sik1Q60670 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Sik1Q60670 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Sik1Q60670 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Sik1Q60670 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Sik1Q60670 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Sik1Q60670 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Sik1Q60670 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Sik1Q60670 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Sik1Q60670 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Sik1Q60670 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Sik1Q60670 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Sik1Q60670 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Sik1Q60670 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Sik1Q60670 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Sik1Q60670 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Sik1Q60670 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Sik1Q60670 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Sik1Q60670 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Sik1Q60670 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Sik1Q60670 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Sik1Q60670 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Sik1Q60670 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Sik1Q60670 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Sik1Q60670 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Sik1Q60670 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Sik1Q60670 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Sik1Q60670 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Sik1Q60670 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Sik1Q60670 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Sik1Q60670 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Sik1Q60670 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Sik1Q60670 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.5 ms