Protein–RNA interactions for Protein: Q5XPI3

Rnf123, E3 ubiquitin-protein ligase RNF123, mousemouse

Predictions only

Length 1,314 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf123Q5XPI3 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Rnf123Q5XPI3 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Rnf123Q5XPI3 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Rnf123Q5XPI3 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Rnf123Q5XPI3 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Rnf123Q5XPI3 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Rnf123Q5XPI3 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Rnf123Q5XPI3 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Rnf123Q5XPI3 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Rnf123Q5XPI3 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
Rnf123Q5XPI3 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Rnf123Q5XPI3 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Rnf123Q5XPI3 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Rnf123Q5XPI3 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Rnf123Q5XPI3 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Rnf123Q5XPI3 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Rnf123Q5XPI3 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Rnf123Q5XPI3 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Rnf123Q5XPI3 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Rnf123Q5XPI3 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Rnf123Q5XPI3 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Rnf123Q5XPI3 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Rnf123Q5XPI3 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Rnf123Q5XPI3 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Rnf123Q5XPI3 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Rnf123Q5XPI3 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Rnf123Q5XPI3 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Rnf123Q5XPI3 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Rnf123Q5XPI3 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Rnf123Q5XPI3 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Rnf123Q5XPI3 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Rnf123Q5XPI3 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Rnf123Q5XPI3 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Rnf123Q5XPI3 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Rnf123Q5XPI3 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Rnf123Q5XPI3 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Rnf123Q5XPI3 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Rnf123Q5XPI3 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Rnf123Q5XPI3 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
Rnf123Q5XPI3 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
Rnf123Q5XPI3 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
Rnf123Q5XPI3 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Rnf123Q5XPI3 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
Rnf123Q5XPI3 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Rnf123Q5XPI3 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Rnf123Q5XPI3 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Rnf123Q5XPI3 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Rnf123Q5XPI3 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Rnf123Q5XPI3 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Rnf123Q5XPI3 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Rnf123Q5XPI3 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Rnf123Q5XPI3 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Rnf123Q5XPI3 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Rnf123Q5XPI3 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Rnf123Q5XPI3 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Rnf123Q5XPI3 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Rnf123Q5XPI3 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Rnf123Q5XPI3 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Rnf123Q5XPI3 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Rnf123Q5XPI3 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Rnf123Q5XPI3 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Rnf123Q5XPI3 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Rnf123Q5XPI3 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Rnf123Q5XPI3 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Rnf123Q5XPI3 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Rnf123Q5XPI3 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Rnf123Q5XPI3 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Rnf123Q5XPI3 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Rnf123Q5XPI3 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Rnf123Q5XPI3 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Rnf123Q5XPI3 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Rnf123Q5XPI3 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Rnf123Q5XPI3 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Rnf123Q5XPI3 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Rnf123Q5XPI3 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Rnf123Q5XPI3 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Rnf123Q5XPI3 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Rnf123Q5XPI3 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Rnf123Q5XPI3 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Rnf123Q5XPI3 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Rnf123Q5XPI3 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Rnf123Q5XPI3 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Rnf123Q5XPI3 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Rnf123Q5XPI3 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Rnf123Q5XPI3 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Rnf123Q5XPI3 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Rnf123Q5XPI3 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Rnf123Q5XPI3 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Rnf123Q5XPI3 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Rnf123Q5XPI3 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Rnf123Q5XPI3 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Rnf123Q5XPI3 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Rnf123Q5XPI3 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Rnf123Q5XPI3 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Rnf123Q5XPI3 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Rnf123Q5XPI3 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Rnf123Q5XPI3 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Rnf123Q5XPI3 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Rnf123Q5XPI3 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Rnf123Q5XPI3 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.4 ms