Protein–RNA interactions for Protein: Q5U430

Ubr3, E3 ubiquitin-protein ligase UBR3, mousemouse

Predictions only

Length 1,889 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubr3Q5U430 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ubr3Q5U430 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ubr3Q5U430 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ubr3Q5U430 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ubr3Q5U430 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ubr3Q5U430 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ubr3Q5U430 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ubr3Q5U430 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ubr3Q5U430 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ubr3Q5U430 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ubr3Q5U430 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ubr3Q5U430 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ubr3Q5U430 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ubr3Q5U430 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ubr3Q5U430 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ubr3Q5U430 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ubr3Q5U430 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ubr3Q5U430 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ubr3Q5U430 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ubr3Q5U430 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ubr3Q5U430 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ubr3Q5U430 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ubr3Q5U430 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ubr3Q5U430 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
Ubr3Q5U430 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
Ubr3Q5U430 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Ubr3Q5U430 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Ubr3Q5U430 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ubr3Q5U430 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ubr3Q5U430 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ubr3Q5U430 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ubr3Q5U430 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ubr3Q5U430 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ubr3Q5U430 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ubr3Q5U430 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ubr3Q5U430 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ubr3Q5U430 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ubr3Q5U430 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ubr3Q5U430 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ubr3Q5U430 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Ubr3Q5U430 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ubr3Q5U430 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Ubr3Q5U430 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ubr3Q5U430 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ubr3Q5U430 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ubr3Q5U430 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ubr3Q5U430 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ubr3Q5U430 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ubr3Q5U430 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ubr3Q5U430 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ubr3Q5U430 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ubr3Q5U430 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ubr3Q5U430 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Ubr3Q5U430 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ubr3Q5U430 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ubr3Q5U430 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ubr3Q5U430 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ubr3Q5U430 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ubr3Q5U430 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ubr3Q5U430 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ubr3Q5U430 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ubr3Q5U430 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ubr3Q5U430 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ubr3Q5U430 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ubr3Q5U430 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ubr3Q5U430 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ubr3Q5U430 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ubr3Q5U430 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ubr3Q5U430 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ubr3Q5U430 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ubr3Q5U430 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ubr3Q5U430 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ubr3Q5U430 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ubr3Q5U430 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ubr3Q5U430 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ubr3Q5U430 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ubr3Q5U430 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ubr3Q5U430 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ubr3Q5U430 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ubr3Q5U430 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ubr3Q5U430 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ubr3Q5U430 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ubr3Q5U430 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ubr3Q5U430 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Ubr3Q5U430 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ubr3Q5U430 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ubr3Q5U430 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ubr3Q5U430 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ubr3Q5U430 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Ubr3Q5U430 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ubr3Q5U430 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ubr3Q5U430 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ubr3Q5U430 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ubr3Q5U430 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ubr3Q5U430 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.19
Ubr3Q5U430 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ubr3Q5U430 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ubr3Q5U430 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ubr3Q5U430 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ubr3Q5U430 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.8 ms