Protein–RNA interactions for Protein: Q5SXJ3

Brip1, Fanconi anemia group J protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,174 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brip1Q5SXJ3 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Brip1Q5SXJ3 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Brip1Q5SXJ3 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
Brip1Q5SXJ3 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Brip1Q5SXJ3 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
Brip1Q5SXJ3 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Brip1Q5SXJ3 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Brip1Q5SXJ3 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Brip1Q5SXJ3 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Brip1Q5SXJ3 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Brip1Q5SXJ3 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Brip1Q5SXJ3 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Brip1Q5SXJ3 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Brip1Q5SXJ3 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Brip1Q5SXJ3 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Brip1Q5SXJ3 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Brip1Q5SXJ3 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Brip1Q5SXJ3 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Brip1Q5SXJ3 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Brip1Q5SXJ3 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Brip1Q5SXJ3 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Brip1Q5SXJ3 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Brip1Q5SXJ3 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Brip1Q5SXJ3 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Brip1Q5SXJ3 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Brip1Q5SXJ3 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Brip1Q5SXJ3 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Brip1Q5SXJ3 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Brip1Q5SXJ3 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Brip1Q5SXJ3 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Brip1Q5SXJ3 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Brip1Q5SXJ3 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Brip1Q5SXJ3 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Brip1Q5SXJ3 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Brip1Q5SXJ3 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Brip1Q5SXJ3 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Brip1Q5SXJ3 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Brip1Q5SXJ3 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Brip1Q5SXJ3 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Brip1Q5SXJ3 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Brip1Q5SXJ3 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Brip1Q5SXJ3 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Brip1Q5SXJ3 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Brip1Q5SXJ3 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Brip1Q5SXJ3 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Brip1Q5SXJ3 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Brip1Q5SXJ3 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Brip1Q5SXJ3 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Brip1Q5SXJ3 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Brip1Q5SXJ3 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Brip1Q5SXJ3 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Brip1Q5SXJ3 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Brip1Q5SXJ3 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Brip1Q5SXJ3 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Brip1Q5SXJ3 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Brip1Q5SXJ3 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
Brip1Q5SXJ3 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
Brip1Q5SXJ3 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Brip1Q5SXJ3 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Brip1Q5SXJ3 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Brip1Q5SXJ3 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Brip1Q5SXJ3 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Brip1Q5SXJ3 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Brip1Q5SXJ3 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Brip1Q5SXJ3 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Brip1Q5SXJ3 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Brip1Q5SXJ3 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
Brip1Q5SXJ3 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Brip1Q5SXJ3 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Brip1Q5SXJ3 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
Brip1Q5SXJ3 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Brip1Q5SXJ3 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Brip1Q5SXJ3 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Brip1Q5SXJ3 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Brip1Q5SXJ3 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Brip1Q5SXJ3 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Brip1Q5SXJ3 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Brip1Q5SXJ3 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Brip1Q5SXJ3 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Brip1Q5SXJ3 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Brip1Q5SXJ3 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Brip1Q5SXJ3 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Brip1Q5SXJ3 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Brip1Q5SXJ3 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Brip1Q5SXJ3 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Brip1Q5SXJ3 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Brip1Q5SXJ3 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Brip1Q5SXJ3 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Brip1Q5SXJ3 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Brip1Q5SXJ3 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Brip1Q5SXJ3 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Brip1Q5SXJ3 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Brip1Q5SXJ3 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
Brip1Q5SXJ3 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Brip1Q5SXJ3 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
Brip1Q5SXJ3 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Brip1Q5SXJ3 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Brip1Q5SXJ3 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Brip1Q5SXJ3 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Brip1Q5SXJ3 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.9 ms