Protein–RNA interactions for Protein: Q5SX40

Myh1, Myosin-1, mousemouse

Predictions only

Length 1,942 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Myh1Q5SX40 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Myh1Q5SX40 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Myh1Q5SX40 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Myh1Q5SX40 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Myh1Q5SX40 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Myh1Q5SX40 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Myh1Q5SX40 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Myh1Q5SX40 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Myh1Q5SX40 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Myh1Q5SX40 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Myh1Q5SX40 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
Myh1Q5SX40 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Myh1Q5SX40 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Myh1Q5SX40 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Myh1Q5SX40 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Myh1Q5SX40 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Myh1Q5SX40 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Myh1Q5SX40 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Myh1Q5SX40 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Myh1Q5SX40 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Myh1Q5SX40 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Myh1Q5SX40 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Myh1Q5SX40 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Myh1Q5SX40 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Myh1Q5SX40 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Myh1Q5SX40 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Myh1Q5SX40 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Myh1Q5SX40 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Myh1Q5SX40 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Myh1Q5SX40 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Myh1Q5SX40 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Myh1Q5SX40 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Myh1Q5SX40 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Myh1Q5SX40 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Myh1Q5SX40 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Myh1Q5SX40 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Myh1Q5SX40 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Myh1Q5SX40 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Myh1Q5SX40 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Myh1Q5SX40 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Myh1Q5SX40 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Myh1Q5SX40 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Myh1Q5SX40 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Myh1Q5SX40 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Myh1Q5SX40 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Myh1Q5SX40 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Myh1Q5SX40 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Myh1Q5SX40 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Myh1Q5SX40 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Myh1Q5SX40 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Myh1Q5SX40 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Myh1Q5SX40 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Myh1Q5SX40 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Myh1Q5SX40 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Myh1Q5SX40 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Myh1Q5SX40 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Myh1Q5SX40 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Myh1Q5SX40 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Myh1Q5SX40 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Myh1Q5SX40 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Myh1Q5SX40 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Myh1Q5SX40 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Myh1Q5SX40 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Myh1Q5SX40 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Myh1Q5SX40 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Myh1Q5SX40 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Myh1Q5SX40 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Myh1Q5SX40 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Myh1Q5SX40 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Myh1Q5SX40 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Myh1Q5SX40 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Myh1Q5SX40 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Myh1Q5SX40 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Myh1Q5SX40 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Myh1Q5SX40 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Myh1Q5SX40 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Myh1Q5SX40 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Myh1Q5SX40 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Myh1Q5SX40 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Myh1Q5SX40 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Myh1Q5SX40 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Myh1Q5SX40 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Myh1Q5SX40 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Myh1Q5SX40 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Myh1Q5SX40 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Myh1Q5SX40 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Myh1Q5SX40 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Myh1Q5SX40 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Myh1Q5SX40 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Myh1Q5SX40 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Myh1Q5SX40 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Myh1Q5SX40 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Myh1Q5SX40 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Myh1Q5SX40 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Myh1Q5SX40 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Myh1Q5SX40 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Myh1Q5SX40 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Myh1Q5SX40 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Myh1Q5SX40 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Myh1Q5SX40 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.3 ms