Protein–RNA interactions for Protein: Q5SUD9

Bbs12, Bardet-Biedl syndrome 12 protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 708 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bbs12Q5SUD9 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Bbs12Q5SUD9 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Bbs12Q5SUD9 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Bbs12Q5SUD9 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Bbs12Q5SUD9 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Bbs12Q5SUD9 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Bbs12Q5SUD9 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Bbs12Q5SUD9 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Bbs12Q5SUD9 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Bbs12Q5SUD9 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Bbs12Q5SUD9 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Bbs12Q5SUD9 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Bbs12Q5SUD9 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Bbs12Q5SUD9 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Bbs12Q5SUD9 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Bbs12Q5SUD9 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Bbs12Q5SUD9 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Bbs12Q5SUD9 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Bbs12Q5SUD9 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Bbs12Q5SUD9 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Bbs12Q5SUD9 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Bbs12Q5SUD9 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Bbs12Q5SUD9 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Bbs12Q5SUD9 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Bbs12Q5SUD9 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Bbs12Q5SUD9 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Bbs12Q5SUD9 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Bbs12Q5SUD9 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Bbs12Q5SUD9 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Bbs12Q5SUD9 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Bbs12Q5SUD9 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Bbs12Q5SUD9 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Bbs12Q5SUD9 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Bbs12Q5SUD9 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Bbs12Q5SUD9 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Bbs12Q5SUD9 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Bbs12Q5SUD9 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Bbs12Q5SUD9 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Bbs12Q5SUD9 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Bbs12Q5SUD9 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Bbs12Q5SUD9 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Bbs12Q5SUD9 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Bbs12Q5SUD9 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Bbs12Q5SUD9 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Bbs12Q5SUD9 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Bbs12Q5SUD9 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Bbs12Q5SUD9 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Bbs12Q5SUD9 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Bbs12Q5SUD9 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Bbs12Q5SUD9 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Bbs12Q5SUD9 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Bbs12Q5SUD9 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Bbs12Q5SUD9 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Bbs12Q5SUD9 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Bbs12Q5SUD9 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Bbs12Q5SUD9 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Bbs12Q5SUD9 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Bbs12Q5SUD9 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Bbs12Q5SUD9 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Bbs12Q5SUD9 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Bbs12Q5SUD9 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Bbs12Q5SUD9 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Bbs12Q5SUD9 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Bbs12Q5SUD9 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Bbs12Q5SUD9 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Bbs12Q5SUD9 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Bbs12Q5SUD9 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Bbs12Q5SUD9 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Bbs12Q5SUD9 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Bbs12Q5SUD9 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Bbs12Q5SUD9 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Bbs12Q5SUD9 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Bbs12Q5SUD9 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Bbs12Q5SUD9 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Bbs12Q5SUD9 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Bbs12Q5SUD9 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Bbs12Q5SUD9 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Bbs12Q5SUD9 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Bbs12Q5SUD9 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Bbs12Q5SUD9 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Bbs12Q5SUD9 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Bbs12Q5SUD9 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Bbs12Q5SUD9 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Bbs12Q5SUD9 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Bbs12Q5SUD9 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Bbs12Q5SUD9 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Bbs12Q5SUD9 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Bbs12Q5SUD9 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Bbs12Q5SUD9 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Bbs12Q5SUD9 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Bbs12Q5SUD9 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Bbs12Q5SUD9 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Bbs12Q5SUD9 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Bbs12Q5SUD9 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Bbs12Q5SUD9 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Bbs12Q5SUD9 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Bbs12Q5SUD9 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Bbs12Q5SUD9 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Bbs12Q5SUD9 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Bbs12Q5SUD9 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.9 ms